湖南农业大学学报（自然科学版）
湖南農業大學學報（自然科學版）
호남농업대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF HUNAN AGRICULTURAL UNIVERSITY(NATURAL SCIENCES)
2011年
2期
199-205
,共7页
郑将臣%万全%程起群%赵金良
鄭將臣%萬全%程起群%趙金良
정장신%만전%정기군%조금량
龟鳖类%16SrRNA基因%遗传分化%分子进化%系统发生
龜鱉類%16SrRNA基因%遺傳分化%分子進化%繫統髮生
구별류%16SrRNA기인%유전분화%분자진화%계통발생
用PCR和测序的方法,获得13种龟鳖类的线粒体16SrRNA基因片段序列,结合NCBI收录的47种龟鳖的线粒体16SrRNA基因序列,分析龟鳖类的遗传分化和系统发生.结果表明,对60条序列进行比对后得到480 bp的一致序列,其中,可变位点229个,总变异率为47.7%;简约信息位点186个,插入/缺失80个.腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)4种碱基的平均含量分别为33.6%、24.3%、18.5%、23.7%,转换与颠换比为1.95.7种闭壳龟种间的遗传距离为0.004～0.063,平均为0.03;潮龟科17个属间的遗传距离为0.053～0.120,平均为0.091;曲颈龟亚目8个科间(不包括平胸龟)的遗传距离为0.071～0.259,平均为0.169.龟科是陆龟科与潮龟科的姐妹群,潮龟科与陆龟科的亲缘关系比龟科与陆龟科的亲缘关系要近;应将乌龟重新归入拟水龟属,将锯缘龟纳入闭壳龟属;闭壳龟属不应拆分为闭壳龟属和盒龟属,即不将黄缘盒龟和黄额盒龟归入盒龟属.
用PCR和測序的方法,穫得13種龜鱉類的線粒體16SrRNA基因片段序列,結閤NCBI收錄的47種龜鱉的線粒體16SrRNA基因序列,分析龜鱉類的遺傳分化和繫統髮生.結果錶明,對60條序列進行比對後得到480 bp的一緻序列,其中,可變位點229箇,總變異率為47.7%;簡約信息位點186箇,插入/缺失80箇.腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)4種堿基的平均含量分彆為33.6%、24.3%、18.5%、23.7%,轉換與顛換比為1.95.7種閉殼龜種間的遺傳距離為0.004～0.063,平均為0.03;潮龜科17箇屬間的遺傳距離為0.053～0.120,平均為0.091;麯頸龜亞目8箇科間(不包括平胸龜)的遺傳距離為0.071～0.259,平均為0.169.龜科是陸龜科與潮龜科的姐妹群,潮龜科與陸龜科的親緣關繫比龜科與陸龜科的親緣關繫要近;應將烏龜重新歸入擬水龜屬,將鋸緣龜納入閉殼龜屬;閉殼龜屬不應拆分為閉殼龜屬和盒龜屬,即不將黃緣盒龜和黃額盒龜歸入盒龜屬.
용PCR화측서적방법,획득13충구별류적선립체16SrRNA기인편단서렬,결합NCBI수록적47충구별적선립체16SrRNA기인서렬,분석구별류적유전분화화계통발생.결과표명,대60조서렬진행비대후득도480 bp적일치서렬,기중,가변위점229개,총변이솔위47.7%;간약신식위점186개,삽입/결실80개.선표령(A)、흉선밀정(T)、조표령(G)、포밀정(C)4충감기적평균함량분별위33.6%、24.3%、18.5%、23.7%,전환여전환비위1.95.7충폐각구충간적유전거리위0.004～0.063,평균위0.03;조구과17개속간적유전거리위0.053～0.120,평균위0.091;곡경구아목8개과간(불포괄평흉구)적유전거리위0.071～0.259,평균위0.169.구과시륙구과여조구과적저매군,조구과여륙구과적친연관계비구과여륙구과적친연관계요근;응장오구중신귀입의수구속,장거연구납입폐각구속;폐각구속불응탁분위폐각구속화합구속,즉불장황연합구화황액합구귀입합구속.
