食品与发酵科技
食品與髮酵科技
식품여발효과기
SICHUAN FOOD AND FERMENTATION
2012年
2期
9-12
,共4页
张晓娟%宋萍%王柱%张蓓蓓%周光燕%王菊英
張曉娟%宋萍%王柱%張蓓蓓%週光燕%王菊英
장효연%송평%왕주%장배배%주광연%왕국영
芽孢杆菌%16S rRNA%序列分析%系统发育
芽孢桿菌%16S rRNA%序列分析%繫統髮育
아포간균%16S rRNA%서렬분석%계통발육
采用16S rRNA基因序列分析对西南菌种站(SICC)收集保藏的23株芽孢杆菌进行复核鉴定,以改良的CTAB 法提取细菌DNA,用通用引物F1、R1对菌株进行16S rRNA扩增,使用Clustal X对序列进行比对分析,并用MEGA 4进行建树分析.鉴定结果表明其中13株与原学名一致,1株与原学名不符,其余9株在绘制的N-J发育树中显示同时与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtis)、解淀粉芽孢杆菌(B.amyloliquefaciens)汇聚到一个分支,需要用特异PCR方法进一步核实.
採用16S rRNA基因序列分析對西南菌種站(SICC)收集保藏的23株芽孢桿菌進行複覈鑒定,以改良的CTAB 法提取細菌DNA,用通用引物F1、R1對菌株進行16S rRNA擴增,使用Clustal X對序列進行比對分析,併用MEGA 4進行建樹分析.鑒定結果錶明其中13株與原學名一緻,1株與原學名不符,其餘9株在繪製的N-J髮育樹中顯示同時與枯草芽孢桿菌(Bacillus subtis)、解澱粉芽孢桿菌(B.amyloliquefaciens)彙聚到一箇分支,需要用特異PCR方法進一步覈實.
채용16S rRNA기인서렬분석대서남균충참(SICC)수집보장적23주아포간균진행복핵감정,이개량적CTAB 법제취세균DNA,용통용인물F1、R1대균주진행16S rRNA확증,사용Clustal X대서렬진행비대분석,병용MEGA 4진행건수분석.감정결과표명기중13주여원학명일치,1주여원학명불부,기여9주재회제적N-J발육수중현시동시여고초아포간균(Bacillus subtis)、해정분아포간균(B.amyloliquefaciens)회취도일개분지,수요용특이PCR방법진일보핵실.
