苏州大学学报(医学版)
囌州大學學報(醫學版)
소주대학학보(의학판)
SUZHOU UNIVERSITY JOURNAL OF MEDICAL SCIENCE
2005年
5期
787-791,799
,共6页
董秋明%马力杰%杭赛宇%高磊%张学光
董鞦明%馬力傑%杭賽宇%高磊%張學光
동추명%마력걸%항새우%고뢰%장학광
TNF超家族%大鼠%4-1BBL%cDNA%克隆%染色体定位
TNF超傢族%大鼠%4-1BBL%cDNA%剋隆%染色體定位
TNF초가족%대서%4-1BBL%cDNA%극륭%염색체정위
目的克隆、分析并染色体定位肿瘤坏死因子配体超家族(Tumor Necrosis Factor Superfamily,TNFSF)成员4-1BBL分子.方法在对小鼠、人4-1BBL mRNA进行生物信息学分析的基础上,采用PCR扩增、T载体克隆测序等实验技术,并用软件对基因进行了拼接、序列分析及同源性比较,同时通过荧光原位杂交(FISH)技术对该基因进行了染色体定位.结果首次获得了具有完整开放阅读框的大鼠cDNA,GenBank 登录号为 No. AY259541,通过同源性比较分析,证明该基因与小鼠高度同源,编码区的核苷酸序列与小鼠、人的同源性分别为 88%、37%.推导出的大鼠4-1BBL蛋白质由308个氨基酸分子组成,分子量为33469d,胞外区有三个潜在的N糖基化位点:AA138,AA160和AA292,是典型的Ⅱ型糖蛋白,与小鼠、人在氨基酸水平的同源性分别为83%、31%,其中胞质区为76%、32%,跨膜区为45%、40%,胞外区为87%、28%.该基因定位于大鼠染色体9q1(GenBank UniGene 登录号为No.Rn.46783).结论大鼠4-1BBL胞内区的"SDAA"可能发挥着TNF家族中具有逆信号的其他成员的胞内区酪氨酸激酶Ⅰ磷酸化位点"SXXS"的作用.大鼠4-1BBLcDNA的成功克隆与定位为探讨4-1BBL在免疫共刺激中的作用机制以及TNF分子的进化研究打下了基础.
目的剋隆、分析併染色體定位腫瘤壞死因子配體超傢族(Tumor Necrosis Factor Superfamily,TNFSF)成員4-1BBL分子.方法在對小鼠、人4-1BBL mRNA進行生物信息學分析的基礎上,採用PCR擴增、T載體剋隆測序等實驗技術,併用軟件對基因進行瞭拼接、序列分析及同源性比較,同時通過熒光原位雜交(FISH)技術對該基因進行瞭染色體定位.結果首次穫得瞭具有完整開放閱讀框的大鼠cDNA,GenBank 登錄號為 No. AY259541,通過同源性比較分析,證明該基因與小鼠高度同源,編碼區的覈苷痠序列與小鼠、人的同源性分彆為 88%、37%.推導齣的大鼠4-1BBL蛋白質由308箇氨基痠分子組成,分子量為33469d,胞外區有三箇潛在的N糖基化位點:AA138,AA160和AA292,是典型的Ⅱ型糖蛋白,與小鼠、人在氨基痠水平的同源性分彆為83%、31%,其中胞質區為76%、32%,跨膜區為45%、40%,胞外區為87%、28%.該基因定位于大鼠染色體9q1(GenBank UniGene 登錄號為No.Rn.46783).結論大鼠4-1BBL胞內區的"SDAA"可能髮揮著TNF傢族中具有逆信號的其他成員的胞內區酪氨痠激酶Ⅰ燐痠化位點"SXXS"的作用.大鼠4-1BBLcDNA的成功剋隆與定位為探討4-1BBL在免疫共刺激中的作用機製以及TNF分子的進化研究打下瞭基礎.
목적극륭、분석병염색체정위종류배사인자배체초가족(Tumor Necrosis Factor Superfamily,TNFSF)성원4-1BBL분자.방법재대소서、인4-1BBL mRNA진행생물신식학분석적기출상,채용PCR확증、T재체극륭측서등실험기술,병용연건대기인진행료병접、서렬분석급동원성비교,동시통과형광원위잡교(FISH)기술대해기인진행료염색체정위.결과수차획득료구유완정개방열독광적대서cDNA,GenBank 등록호위 No. AY259541,통과동원성비교분석,증명해기인여소서고도동원,편마구적핵감산서렬여소서、인적동원성분별위 88%、37%.추도출적대서4-1BBL단백질유308개안기산분자조성,분자량위33469d,포외구유삼개잠재적N당기화위점:AA138,AA160화AA292,시전형적Ⅱ형당단백,여소서、인재안기산수평적동원성분별위83%、31%,기중포질구위76%、32%,과막구위45%、40%,포외구위87%、28%.해기인정위우대서염색체9q1(GenBank UniGene 등록호위No.Rn.46783).결론대서4-1BBL포내구적"SDAA"가능발휘착TNF가족중구유역신호적기타성원적포내구락안산격매Ⅰ린산화위점"SXXS"적작용.대서4-1BBLcDNA적성공극륭여정위위탐토4-1BBL재면역공자격중적작용궤제이급TNF분자적진화연구타하료기출.