遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2010年
9期
951-960
,共10页
黑尾地鸦%线粒体基因组%rRNA二级结构%控制区
黑尾地鴉%線粒體基因組%rRNA二級結構%控製區
흑미지아%선립체기인조%rRNA이급결구%공제구
采用长PCR扩增的线粒体DNA和引物步移法, 测定并注释了中国特有鸟类-黑尾地鸦(Podoces hendersoni)的线粒体基因组全序列.黑尾地鸦的mtDNA序列全长16 867 bp, GenBank登录号GU592504.基因含量和排列次序与原鸡的一致,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA、2个rRNA和1个控制区(D-loop).除COI基因以GTG作为起始密码子外, 其余12个蛋白质编码基因均以典型ATG密码子起始.11个蛋白编码基因以完全终止密码子TAA、AGG或AGA终止, COIII和ND4基因终止密码子为不完整的T.tRNASer(AGY)的DHU臂缺失, tRNALeu(CUN)的反密码子环由9个碱基构成, 而不是标准的7个碱基.其余的20个tRNA基因的二级结构均属典型的三叶草结构.预测了rRNA的二级结构, 其中, 12S rRNA二级结构包含4个结构域, 43个茎环结构; 16S rRNA的二级结构包含6个结构域, 55个茎环结构.此外, 在其他鸟类控制区中所发现的F-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box和CSB1-box也同样存在于黑尾地鸦中.
採用長PCR擴增的線粒體DNA和引物步移法, 測定併註釋瞭中國特有鳥類-黑尾地鴉(Podoces hendersoni)的線粒體基因組全序列.黑尾地鴉的mtDNA序列全長16 867 bp, GenBank登錄號GU592504.基因含量和排列次序與原鷄的一緻,包含13箇蛋白編碼基因、22箇tRNA、2箇rRNA和1箇控製區(D-loop).除COI基因以GTG作為起始密碼子外, 其餘12箇蛋白質編碼基因均以典型ATG密碼子起始.11箇蛋白編碼基因以完全終止密碼子TAA、AGG或AGA終止, COIII和ND4基因終止密碼子為不完整的T.tRNASer(AGY)的DHU臂缺失, tRNALeu(CUN)的反密碼子環由9箇堿基構成, 而不是標準的7箇堿基.其餘的20箇tRNA基因的二級結構均屬典型的三葉草結構.預測瞭rRNA的二級結構, 其中, 12S rRNA二級結構包含4箇結構域, 43箇莖環結構; 16S rRNA的二級結構包含6箇結構域, 55箇莖環結構.此外, 在其他鳥類控製區中所髮現的F-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box和CSB1-box也同樣存在于黑尾地鴉中.
채용장PCR확증적선립체DNA화인물보이법, 측정병주석료중국특유조류-흑미지아(Podoces hendersoni)적선립체기인조전서렬.흑미지아적mtDNA서렬전장16 867 bp, GenBank등록호GU592504.기인함량화배렬차서여원계적일치,포함13개단백편마기인、22개tRNA、2개rRNA화1개공제구(D-loop).제COI기인이GTG작위기시밀마자외, 기여12개단백질편마기인균이전형ATG밀마자기시.11개단백편마기인이완전종지밀마자TAA、AGG혹AGA종지, COIII화ND4기인종지밀마자위불완정적T.tRNASer(AGY)적DHU비결실, tRNALeu(CUN)적반밀마자배유9개감기구성, 이불시표준적7개감기.기여적20개tRNA기인적이급결구균속전형적삼협초결구.예측료rRNA적이급결구, 기중, 12S rRNA이급결구포함4개결구역, 43개경배결구; 16S rRNA적이급결구포함6개결구역, 55개경배결구.차외, 재기타조류공제구중소발현적F-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box화CSB1-box야동양존재우흑미지아중.