CAJ | 학술논문

松材线虫是松材线虫病的病原,且与其伴生细菌之间存在互作.为研究松材线虫和伴生细菌的互作关系,本研究用Nycodenz介质离心和SDS裂解法富集松材线虫的伴生细菌,以酚/氯仿抽提法提取DNA,构建了松材线虫伴生细菌fosmid宏基因组文库.文库克隆的插入片段大小分布在30～45 kb,平均长度为40 kb.该文库包含19 200个克隆,共计包含7 680 000 kb DNA.文库稳定性检测表明插入的DNA片段能够在fosmid质粒中稳定遗传,没有发现插入片段丢失或重排.随机挑选96个克隆进行末端测序,BLAST分析表明:该文库中松材线虫序列占5.2%,细菌序列占64.6%,无同源序列14.6%.对伴生细菌多样性分析表明:Stenotrophomonas为优势种群,Sphingomonas、Cupriavidus和Pseudomonas为次优势种群.该文库的建立为揭示松材线虫与其伴生细菌的互作关系及伴生细菌的生态功能奠定了基础.
송재선충시송재선충병적병원,차여기반생세균지간존재호작.위연구송재선충화반생세균적호작관계,본연구용Nycodenz개질리심화SDS렬해법부집송재선충적반생세균,이분/록방추제법제취DNA,구건료송재선충반생세균fosmid굉기인조문고.문고극륭적삽입편단대소분포재30～45 kb,평균장도위40 kb.해문고포함19 200개극륭,공계포함7 680 000 kb DNA.문고은정성검측표명삽입적DNA편단능구재fosmid질립중은정유전,몰유발현삽입편단주실혹중배.수궤도선96개극륭진행말단측서,BLAST분석표명:해문고중송재선충서렬점5.2%,세균서렬점64.6%,무동원서렬14.6%.대반생세균다양성분석표명:Stenotrophomonas위우세충군,Sphingomonas、Cupriavidus화Pseudomonas위차우세충군.해문고적건립위게시송재선충여기반생세균적호작관계급반생세균적생태공능전정료기출.