寄生虫与医学昆虫学报
寄生蟲與醫學昆蟲學報
기생충여의학곤충학보
ACTA PARASITOLOGICA ET MEDICA ENTOMOLOGICA SINICA
2010年
4期
193-197
,共5页
于师宇%李巍%宫鹏涛%张西臣%李建华%李春雨%苏利波%刁玉梅
于師宇%李巍%宮鵬濤%張西臣%李建華%李春雨%囌利波%刁玉梅
우사우%리외%궁붕도%장서신%리건화%리춘우%소리파%조옥매
微小隐孢子虫%18S rRNA%序列分析
微小隱孢子蟲%18S rRNA%序列分析
미소은포자충%18S rRNA%서렬분석
设计Nested PCR引物扩增牛源微小隐孢子虫Cryptospordium parvum、羊源微小隐孢子虫C. parvum、牛源安氏隐孢子虫C. andersoni、鸡源贝氏隐孢子虫C. baileyi及猪源隐孢子虫C. suis 18S rRNA基因突变区,PCR产物经克隆测序,其片段大小分别为212、213、213、213和210 bp.将测得的序列用DNAStar软件分析并与NCBI数据库中相同与相近种株序列进行相似性比较, 进行相似性分析并用TREECON软件绘制系统发育进化树.结果表明测得的5株隐孢子虫与各自相同种相似性为98.1%～100%,与其他种相似性为90.1%～98.6%.分析显示在此突变区设置特异酶切位点能区分开C. parvum, C. andersoni, C. baileyi与C. suis,位点分别是TaqI、BstUI、MseI.本研究为我国隐孢子虫分类、分子流行病学研究提供了新的方法.
設計Nested PCR引物擴增牛源微小隱孢子蟲Cryptospordium parvum、羊源微小隱孢子蟲C. parvum、牛源安氏隱孢子蟲C. andersoni、鷄源貝氏隱孢子蟲C. baileyi及豬源隱孢子蟲C. suis 18S rRNA基因突變區,PCR產物經剋隆測序,其片段大小分彆為212、213、213、213和210 bp.將測得的序列用DNAStar軟件分析併與NCBI數據庫中相同與相近種株序列進行相似性比較, 進行相似性分析併用TREECON軟件繪製繫統髮育進化樹.結果錶明測得的5株隱孢子蟲與各自相同種相似性為98.1%～100%,與其他種相似性為90.1%～98.6%.分析顯示在此突變區設置特異酶切位點能區分開C. parvum, C. andersoni, C. baileyi與C. suis,位點分彆是TaqI、BstUI、MseI.本研究為我國隱孢子蟲分類、分子流行病學研究提供瞭新的方法.
설계Nested PCR인물확증우원미소은포자충Cryptospordium parvum、양원미소은포자충C. parvum、우원안씨은포자충C. andersoni、계원패씨은포자충C. baileyi급저원은포자충C. suis 18S rRNA기인돌변구,PCR산물경극륭측서,기편단대소분별위212、213、213、213화210 bp.장측득적서렬용DNAStar연건분석병여NCBI수거고중상동여상근충주서렬진행상사성비교, 진행상사성분석병용TREECON연건회제계통발육진화수.결과표명측득적5주은포자충여각자상동충상사성위98.1%～100%,여기타충상사성위90.1%～98.6%.분석현시재차돌변구설치특이매절위점능구분개C. parvum, C. andersoni, C. baileyi여C. suis,위점분별시TaqI、BstUI、MseI.본연구위아국은포자충분류、분자류행병학연구제공료신적방법.
