CAJ | 학술논문

介绍了研制的功能相关基因模块的共表达信息融合分析软件GeneHub的7个功能模块:数据提交及分解、统一编号、数据标准化、差异表达基因筛选、基因功能分组、表达相关性统计分析和综合评价,GeneHub涉及的生物学.数据库(LocusLink、Unists、GO、KEGG、BIND、MIPS).应用GeneHub,可选择不同的表达相似性测度(欧氏距离,Pearson相关系数,Spearman相关系数)在不同的实验数据集上研究功能相关基因的表达相关性.GeneHub已被用于研究按染色体定位、蛋白质互作及蛋白质复合物、调控通路、信号传导通路和细胞位置5个方面的基因功能分类体系下基因组共表达现象.该软件有利于整合其他多种基因组信息源,从而为采用信息融合分析技术挖掘基因表达谱数据和发现新的基因功能知识建立了很好的基础.
개소료연제적공능상관기인모괴적공표체신식융합분석연건GeneHub적7개공능모괴:수거제교급분해、통일편호、수거표준화、차이표체기인사선、기인공능분조、표체상관성통계분석화종합평개,GeneHub섭급적생물학.수거고(LocusLink、Unists、GO、KEGG、BIND、MIPS).응용GeneHub,가선택불동적표체상사성측도(구씨거리,Pearson상관계수,Spearman상관계수)재불동적실험수거집상연구공능상관기인적표체상관성.GeneHub이피용우연구안염색체정위、단백질호작급단백질복합물、조공통로、신호전도통로화세포위치5개방면적기인공능분류체계하기인조공표체현상.해연건유리우정합기타다충기인조신식원,종이위채용신식융합분석기술알굴기인표체보수거화발현신적기인공능지식건립료흔호적기출.