甘肃农业大学学报
甘肅農業大學學報
감숙농업대학학보
JOURNAL OF GANSU AGRICULTURAL UNIVERSITY
2010年
3期
1-6,13
,共7页
李玩生%刘磊%冯海燕%房永祥%景志忠
李玩生%劉磊%馮海燕%房永祥%景誌忠
리완생%류뢰%풍해연%방영상%경지충
猪TCR-β链基因%基因克隆%生物信息学%结构预测
豬TCR-β鏈基因%基因剋隆%生物信息學%結構預測
저TCR-β련기인%기인극륭%생물신식학%결구예측
以GenBank上登载的猪的T细胞受体β(pTCR-β)基因为参考序列,用RT-PCR法从猪的外周血淋巴细胞中克隆了TCR-β链基因,并进行生物信息学分析.结果表明:pTCR-β基因含有一个完整的开放阅读框架(ORF),大小为849 bp,编码283个氨基酸,且含有一段27个氨基酸的信号肽序列,与参考序列相比,在核苷酸序列上的同源性为80.4 %,在氨基酸序列上的同源性为70.3 %;生物信息学结构预测发现2个结构域,一个为IG结构域,由第32-138位共107个氨基酸残基组成;另一个为IG_LIKE结构域,由第164-211位共48个氨基酸残基组成.
以GenBank上登載的豬的T細胞受體β(pTCR-β)基因為參攷序列,用RT-PCR法從豬的外週血淋巴細胞中剋隆瞭TCR-β鏈基因,併進行生物信息學分析.結果錶明:pTCR-β基因含有一箇完整的開放閱讀框架(ORF),大小為849 bp,編碼283箇氨基痠,且含有一段27箇氨基痠的信號肽序列,與參攷序列相比,在覈苷痠序列上的同源性為80.4 %,在氨基痠序列上的同源性為70.3 %;生物信息學結構預測髮現2箇結構域,一箇為IG結構域,由第32-138位共107箇氨基痠殘基組成;另一箇為IG_LIKE結構域,由第164-211位共48箇氨基痠殘基組成.
이GenBank상등재적저적T세포수체β(pTCR-β)기인위삼고서렬,용RT-PCR법종저적외주혈림파세포중극륭료TCR-β련기인,병진행생물신식학분석.결과표명:pTCR-β기인함유일개완정적개방열독광가(ORF),대소위849 bp,편마283개안기산,차함유일단27개안기산적신호태서렬,여삼고서렬상비,재핵감산서렬상적동원성위80.4 %,재안기산서렬상적동원성위70.3 %;생물신식학결구예측발현2개결구역,일개위IG결구역,유제32-138위공107개안기산잔기조성;령일개위IG_LIKE결구역,유제164-211위공48개안기산잔기조성.
