计算机工程与应用
計算機工程與應用
계산궤공정여응용
COMPUTER ENGINEERING AND APPLICATIONS
2012年
7期
95-98
,共4页
李正夫%郭权%邹翔%王亮
李正伕%郭權%鄒翔%王亮
리정부%곽권%추상%왕량
网格%药物筛选%分子对接%局域网
網格%藥物篩選%分子對接%跼域網
망격%약물사선%분자대접%국역망
在计算机辅助药物设计中,虚拟筛选是非常重要的一种方法,但其需要的计算量非常巨大.虚拟筛选网格平台,是在局域网环境下使用普通的PC机进行搭建的,可以提供很强的计算能力.相比于并行机而言,它的成本非常低廉.使用的是各个计算节点的空闲资源,并不影响计算节点的自身实际工作.针对局域网的通信成本低的特点,通过适当地减小计算粒度,更好地平衡了计算节点的负载,提高了网格平台的处理能力.在平台上进行了分子筛选实验工作,并与传统计算方法进行时间上的对比分析,结果表明该网格平台在进行虚拟筛选时能够提供非常好的计算性能.
在計算機輔助藥物設計中,虛擬篩選是非常重要的一種方法,但其需要的計算量非常巨大.虛擬篩選網格平檯,是在跼域網環境下使用普通的PC機進行搭建的,可以提供很彊的計算能力.相比于併行機而言,它的成本非常低廉.使用的是各箇計算節點的空閒資源,併不影響計算節點的自身實際工作.針對跼域網的通信成本低的特點,通過適噹地減小計算粒度,更好地平衡瞭計算節點的負載,提高瞭網格平檯的處理能力.在平檯上進行瞭分子篩選實驗工作,併與傳統計算方法進行時間上的對比分析,結果錶明該網格平檯在進行虛擬篩選時能夠提供非常好的計算性能.
재계산궤보조약물설계중,허의사선시비상중요적일충방법,단기수요적계산량비상거대.허의사선망격평태,시재국역망배경하사용보통적PC궤진행탑건적,가이제공흔강적계산능력.상비우병행궤이언,타적성본비상저렴.사용적시각개계산절점적공한자원,병불영향계산절점적자신실제공작.침대국역망적통신성본저적특점,통과괄당지감소계산립도,경호지평형료계산절점적부재,제고료망격평태적처리능력.재평태상진행료분자사선실험공작,병여전통계산방법진행시간상적대비분석,결과표명해망격평태재진행허의사선시능구제공비상호적계산성능.
