华北农学报
華北農學報
화북농학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA
2008年
z1期
257-262
,共6页
张洪沂%赵勇%戴习林%潘迎捷
張洪沂%趙勇%戴習林%潘迎捷
장홍기%조용%대습림%반영첩
南美白对虾%16SrDNA克隆文库%弧菌属
南美白對蝦%16SrDNA剋隆文庫%弧菌屬
남미백대하%16SrDNA극륭문고%호균속
弧菌是最常见、最重要的细菌性病原菌,采用16 S rDNA 克隆文库法对南美白对虾(Litopenaeus vannarnei)养殖系统中水体和底泥的弧菌为主的致病群落的组成进行分析研究.从水体和底泥16 S rDNA克隆文库中各随机挑选55个克隆子进行测序(约114 bp) , 对测序结果进行了BLAST比对.结果表明:水体样品有16 个OTU,主要Vibrio(弧菌,33.3 %) 、Chloroflexi(绿屈挠菌,18.5%)和Pantoea(泛菌属菌,7.41%);底泥样品有14个OTU,主要是Vibrio(弧菌,50.0%)和Chloroflexi(绿屈挠菌,13.6%);2 个文库比较来看,proteobacterium(变形细菌)仅在水体样品中,Aeromonas(气单胞菌)仅在底泥样品中.用MEGA 4从测序的克隆子中选出30个OTU进行系统发育分析.
弧菌是最常見、最重要的細菌性病原菌,採用16 S rDNA 剋隆文庫法對南美白對蝦(Litopenaeus vannarnei)養殖繫統中水體和底泥的弧菌為主的緻病群落的組成進行分析研究.從水體和底泥16 S rDNA剋隆文庫中各隨機挑選55箇剋隆子進行測序(約114 bp) , 對測序結果進行瞭BLAST比對.結果錶明:水體樣品有16 箇OTU,主要Vibrio(弧菌,33.3 %) 、Chloroflexi(綠屈撓菌,18.5%)和Pantoea(汎菌屬菌,7.41%);底泥樣品有14箇OTU,主要是Vibrio(弧菌,50.0%)和Chloroflexi(綠屈撓菌,13.6%);2 箇文庫比較來看,proteobacterium(變形細菌)僅在水體樣品中,Aeromonas(氣單胞菌)僅在底泥樣品中.用MEGA 4從測序的剋隆子中選齣30箇OTU進行繫統髮育分析.
호균시최상견、최중요적세균성병원균,채용16 S rDNA 극륭문고법대남미백대하(Litopenaeus vannarnei)양식계통중수체화저니적호균위주적치병군락적조성진행분석연구.종수체화저니16 S rDNA극륭문고중각수궤도선55개극륭자진행측서(약114 bp) , 대측서결과진행료BLAST비대.결과표명:수체양품유16 개OTU,주요Vibrio(호균,33.3 %) 、Chloroflexi(록굴뇨균,18.5%)화Pantoea(범균속균,7.41%);저니양품유14개OTU,주요시Vibrio(호균,50.0%)화Chloroflexi(록굴뇨균,13.6%);2 개문고비교래간,proteobacterium(변형세균)부재수체양품중,Aeromonas(기단포균)부재저니양품중.용MEGA 4종측서적극륭자중선출30개OTU진행계통발육분석.
