中国预防兽医学报
中國預防獸醫學報
중국예방수의학보
CHINESE JOURNAL OF PREVENTIVE VETERINARY MEDICINE
2008年
2期
127-131
,共5页
鸡贫血病病毒%核苷酸序列%分子进化树
鷄貧血病病毒%覈苷痠序列%分子進化樹
계빈혈병병독%핵감산서렬%분자진화수
本研究测定了3个鸡贫血病病毒(Chinken anemia virus,CAV)国内分离株及12个直接来源于临床样品的CAV毒株全基因组序列,结果表明15个CAV毒株的全基因组长度和结构与已报道的其它CAV毒株一致,长度均为2 298 nt,包含有3个重叠的ORFs.与GenBank发表的13个毒株序列进行序列比较发现,所有毒株核苷酸序列的相似性在95.2%～99.5%之间,CAV全基因组序列有2个高度变异区(HVR),分别位于1 033 nt～1 470 nt和1 858 nt～2 193 nt.CAV ORF3变异度最高,其5'端2/5处和3'端2/5～1/5处为2个高度变异区.ORF2变异度也较高,主要出现在5'端1/4处,ORF1最为保守.以CAV全基因组核苷酸序列和ORF3核苷酸序列为基础分别构建的CAV毒株分子进化树,均可以将全部CAV毒株划分为2个基因群.我国部分地区分离的大多数毒株,属基因Ⅰ群,与德国Cux-1等主要流行毒株有较为相近的亲缘关系;其它CAV国内毒株,属基因Ⅱ群,与日本G6株和TR20株有着更为相近的关系.
本研究測定瞭3箇鷄貧血病病毒(Chinken anemia virus,CAV)國內分離株及12箇直接來源于臨床樣品的CAV毒株全基因組序列,結果錶明15箇CAV毒株的全基因組長度和結構與已報道的其它CAV毒株一緻,長度均為2 298 nt,包含有3箇重疊的ORFs.與GenBank髮錶的13箇毒株序列進行序列比較髮現,所有毒株覈苷痠序列的相似性在95.2%～99.5%之間,CAV全基因組序列有2箇高度變異區(HVR),分彆位于1 033 nt～1 470 nt和1 858 nt～2 193 nt.CAV ORF3變異度最高,其5'耑2/5處和3'耑2/5～1/5處為2箇高度變異區.ORF2變異度也較高,主要齣現在5'耑1/4處,ORF1最為保守.以CAV全基因組覈苷痠序列和ORF3覈苷痠序列為基礎分彆構建的CAV毒株分子進化樹,均可以將全部CAV毒株劃分為2箇基因群.我國部分地區分離的大多數毒株,屬基因Ⅰ群,與德國Cux-1等主要流行毒株有較為相近的親緣關繫;其它CAV國內毒株,屬基因Ⅱ群,與日本G6株和TR20株有著更為相近的關繫.
본연구측정료3개계빈혈병병독(Chinken anemia virus,CAV)국내분리주급12개직접래원우림상양품적CAV독주전기인조서렬,결과표명15개CAV독주적전기인조장도화결구여이보도적기타CAV독주일치,장도균위2 298 nt,포함유3개중첩적ORFs.여GenBank발표적13개독주서렬진행서렬비교발현,소유독주핵감산서렬적상사성재95.2%～99.5%지간,CAV전기인조서렬유2개고도변이구(HVR),분별위우1 033 nt～1 470 nt화1 858 nt～2 193 nt.CAV ORF3변이도최고,기5'단2/5처화3'단2/5～1/5처위2개고도변이구.ORF2변이도야교고,주요출현재5'단1/4처,ORF1최위보수.이CAV전기인조핵감산서렬화ORF3핵감산서렬위기출분별구건적CAV독주분자진화수,균가이장전부CAV독주화분위2개기인군.아국부분지구분리적대다수독주,속기인Ⅰ군,여덕국Cux-1등주요류행독주유교위상근적친연관계;기타CAV국내독주,속기인Ⅱ군,여일본G6주화TR20주유착경위상근적관계.
