生物技术通讯
生物技術通訊
생물기술통신
LETTERS IN BIOTECHNOLOGY
2008年
1期
47-50
,共4页
超级杂交稻%生物信息学%乙烯反应元件结合蛋白%基因克隆
超級雜交稻%生物信息學%乙烯反應元件結閤蛋白%基因剋隆
초급잡교도%생물신식학%을희반응원건결합단백%기인극륭
目的:从超级杂交稻中克隆乙烯反应元件结合蛋白(EREBP)的cDNA.方法:利用模式植物拟南芥中编码乙烯反应元件结合蛋白的cDNA,对现有的水稻基因组数据库进行搜索,获得一条高同源的未知序列.对这条未知序列的核酸序列和蛋白质序列及其结构、性质、功能等进行生物信息学分析后,以超级杂交稻为材料,用未知序列设计一对简并引物,用RT-PCR技术扩增后进行T-A克隆.结果:生物信息学分析结果表明,这个未知序列应为水稻中编码EREBP的cDNA;克隆后经测序获得一条915 bp的cDNA,BLAST表明这条cDNA序列与未知序列的部分核酸序列的同源性达到了99%;提交NCBI的GenBank后被接受,登录号为EF507537.结论:以生物信息学分析为基础,结合RT-PCR和T-A克隆技术,成功地从超级杂交稻中克隆了EREBP cDNA.
目的:從超級雜交稻中剋隆乙烯反應元件結閤蛋白(EREBP)的cDNA.方法:利用模式植物擬南芥中編碼乙烯反應元件結閤蛋白的cDNA,對現有的水稻基因組數據庫進行搜索,穫得一條高同源的未知序列.對這條未知序列的覈痠序列和蛋白質序列及其結構、性質、功能等進行生物信息學分析後,以超級雜交稻為材料,用未知序列設計一對簡併引物,用RT-PCR技術擴增後進行T-A剋隆.結果:生物信息學分析結果錶明,這箇未知序列應為水稻中編碼EREBP的cDNA;剋隆後經測序穫得一條915 bp的cDNA,BLAST錶明這條cDNA序列與未知序列的部分覈痠序列的同源性達到瞭99%;提交NCBI的GenBank後被接受,登錄號為EF507537.結論:以生物信息學分析為基礎,結閤RT-PCR和T-A剋隆技術,成功地從超級雜交稻中剋隆瞭EREBP cDNA.
목적:종초급잡교도중극륭을희반응원건결합단백(EREBP)적cDNA.방법:이용모식식물의남개중편마을희반응원건결합단백적cDNA,대현유적수도기인조수거고진행수색,획득일조고동원적미지서렬.대저조미지서렬적핵산서렬화단백질서렬급기결구、성질、공능등진행생물신식학분석후,이초급잡교도위재료,용미지서렬설계일대간병인물,용RT-PCR기술확증후진행T-A극륭.결과:생물신식학분석결과표명,저개미지서렬응위수도중편마EREBP적cDNA;극륭후경측서획득일조915 bp적cDNA,BLAST표명저조cDNA서렬여미지서렬적부분핵산서렬적동원성체도료99%;제교NCBI적GenBank후피접수,등록호위EF507537.결론:이생물신식학분석위기출,결합RT-PCR화T-A극륭기술,성공지종초급잡교도중극륭료EREBP cDNA.
