物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
1999年
11期
1011-1016
,共6页
甲硫氨酸-脑啡肽%分子动力学模拟%药效团%构象分析
甲硫氨痠-腦啡肽%分子動力學模擬%藥效糰%構象分析
갑류안산-뇌배태%분자동역학모의%약효단%구상분석
用高温淬火分子动力学模拟方法研究了甲硫氨酸-脑啡肽(Met-enkephalin)在真空中的构象性质.经聚类分析和能量优化得到了十三个低能构象,并与吗啡进行了空间拟合.模拟结果表明,Met-enkephalin是一种构象柔性大的多肽分子,可具有多种构象,主要为Gly2-Gly3和Gly3-Phe4之间的β-折叠型式.大多数的结构具有由氢键连接两个末端残基所形成的假大环,侧链和芳香环定位在假大环的同侧.模拟结果还表明,模型最大的特征是:酪氨酸残基中的氨基N相当于吗啡中哌啶环上的季胺N,酪氨酸残基中的酚环相当于吗啡中的酚环,苯丙氨酸残基中的芳香环相当于吗啡中环己烯环.此肽与吗啡在空间结构(药效基团)上非常相似,都满足阿片受体的要求.所以,它们可作用于同一受体.该模型也能为具有阿片效能的肽和非肽配体的药效团设计提供帮助.
用高溫淬火分子動力學模擬方法研究瞭甲硫氨痠-腦啡肽(Met-enkephalin)在真空中的構象性質.經聚類分析和能量優化得到瞭十三箇低能構象,併與嗎啡進行瞭空間擬閤.模擬結果錶明,Met-enkephalin是一種構象柔性大的多肽分子,可具有多種構象,主要為Gly2-Gly3和Gly3-Phe4之間的β-摺疊型式.大多數的結構具有由氫鍵連接兩箇末耑殘基所形成的假大環,側鏈和芳香環定位在假大環的同側.模擬結果還錶明,模型最大的特徵是:酪氨痠殘基中的氨基N相噹于嗎啡中哌啶環上的季胺N,酪氨痠殘基中的酚環相噹于嗎啡中的酚環,苯丙氨痠殘基中的芳香環相噹于嗎啡中環己烯環.此肽與嗎啡在空間結構(藥效基糰)上非常相似,都滿足阿片受體的要求.所以,它們可作用于同一受體.該模型也能為具有阿片效能的肽和非肽配體的藥效糰設計提供幫助.
용고온쉬화분자동역학모의방법연구료갑류안산-뇌배태(Met-enkephalin)재진공중적구상성질.경취류분석화능량우화득도료십삼개저능구상,병여마배진행료공간의합.모의결과표명,Met-enkephalin시일충구상유성대적다태분자,가구유다충구상,주요위Gly2-Gly3화Gly3-Phe4지간적β-절첩형식.대다수적결구구유유경건련접량개말단잔기소형성적가대배,측련화방향배정위재가대배적동측.모의결과환표명,모형최대적특정시:락안산잔기중적안기N상당우마배중고정배상적계알N,락안산잔기중적분배상당우마배중적분배,분병안산잔기중적방향배상당우마배중배기희배.차태여마배재공간결구(약효기단)상비상상사,도만족아편수체적요구.소이,타문가작용우동일수체.해모형야능위구유아편효능적태화비태배체적약효단설계제공방조.
