CAJ | 학술논문

为了系统性地开发和拓展柑桔SSR标记,通过对公布的柑桔BAC文库末端序列(BAC-End sequence,BES)进行SSR分析,选择1500个SSR位点设计合成并检测323对引物.结果表明:(1)从总长度为28.1 Mb的46 339条序列中共检测出22403个SSR位点,约每2条序列就会出现一个SSR位点,发生频率为48％,相当于平均1.25 kb的序列中就会出现1个SSR,频率约为柑桔EST的2倍,且不同核心重复序列的SSR发生特点与EST也不同.(2)所合成的323对引物中,有效扩增316对,扩增率约98％,173对表现多态性,总多态性比率约55％,多态性引物中单核苷酸重复类型15对,双核苷酸重复类型100对,三核苷酸及以上量复类型58对,表明柑桔BES中具有较为丰富的多态性SSR标记.(3)结合已发表的遗传作图数据,对总计349个多态性位点进行遗传连锁分析,获得的新遗传连锁图谱共含有9个连锁群、334个SSR标记、总长844.2 cM、平均图距2.53 cM,延长和加密了先前的图谱.该研究开发的新SSR标记为开展柑桔遗传鉴定分析和遗传图谱构建提供了新的标记来源,加密的遗传图谱为柑桔的基因定位、图位克隆和标记辅助育种等奠定了基础,SSR分析结果也为其他物种SSR标记的开发提供了参考.
위료계통성지개발화탁전감길SSR표기,통과대공포적감길BAC문고말단서렬(BAC-End sequence,BES)진행SSR분석,선택1500개SSR위점설계합성병검측323대인물.결과표명:(1)종총장도위28.1 Mb적46 339조서렬중공검측출22403개SSR위점,약매2조서렬취회출현일개SSR위점,발생빈솔위48％,상당우평균1.25 kb적서렬중취회출현1개SSR,빈솔약위감길EST적2배,차불동핵심중복서렬적SSR발생특점여EST야불동.(2)소합성적323대인물중,유효확증316대,확증솔약98％,173대표현다태성,총다태성비솔약55％,다태성인물중단핵감산중복류형15대,쌍핵감산중복류형100대,삼핵감산급이상량복류형58대,표명감길BES중구유교위봉부적다태성SSR표기.(3)결합이발표적유전작도수거,대총계349개다태성위점진행유전련쇄분석,획득적신유전련쇄도보공함유9개련쇄군、334개SSR표기、총장844.2 cM、평균도거2.53 cM,연장화가밀료선전적도보.해연구개발적신SSR표기위개전감길유전감정분석화유전도보구건제공료신적표기래원,가밀적유전도보위감길적기인정위、도위극륭화표기보조육충등전정료기출,SSR분석결과야위기타물충SSR표기적개발제공료삼고.