微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2007年
6期
1080-1083
,共4页
看家基因%引物%链霉菌%扩增%测序%高(G+C)mol％
看傢基因%引物%鏈黴菌%擴增%測序%高(G+C)mol％
간가기인%인물%련매균%확증%측서%고(G+C)mol％
看家基因的扩增与测序是进行多基因系统进化分析首先需要解决的问题.针对链霉菌这一群高(G+C)mol%革兰氏阳性细菌,选定4个看家基因:atpD、recA、rpoB和trpB,利用NCBI数据库中已有的2个链霉菌和3个分枝杆菌的全基因组序列,以及另两个链霉菌的recA基因序列,通过软件分析设计了各基因的扩增和测序引物,并优化了扩增反应条件.从所试验的55株链霉菌中,均特异地扩增出了上述4个基因的片段,并成功进行了序列测定,验证了所设计引物的实用性.所归纳的引物设计方法可用于高(G+C)mol%革兰氏阳性细菌的其它看家基因,以促进多基因系统进化研究的开展.
看傢基因的擴增與測序是進行多基因繫統進化分析首先需要解決的問題.針對鏈黴菌這一群高(G+C)mol%革蘭氏暘性細菌,選定4箇看傢基因:atpD、recA、rpoB和trpB,利用NCBI數據庫中已有的2箇鏈黴菌和3箇分枝桿菌的全基因組序列,以及另兩箇鏈黴菌的recA基因序列,通過軟件分析設計瞭各基因的擴增和測序引物,併優化瞭擴增反應條件.從所試驗的55株鏈黴菌中,均特異地擴增齣瞭上述4箇基因的片段,併成功進行瞭序列測定,驗證瞭所設計引物的實用性.所歸納的引物設計方法可用于高(G+C)mol%革蘭氏暘性細菌的其它看傢基因,以促進多基因繫統進化研究的開展.
간가기인적확증여측서시진행다기인계통진화분석수선수요해결적문제.침대련매균저일군고(G+C)mol%혁란씨양성세균,선정4개간가기인:atpD、recA、rpoB화trpB,이용NCBI수거고중이유적2개련매균화3개분지간균적전기인조서렬,이급령량개련매균적recA기인서렬,통과연건분석설계료각기인적확증화측서인물,병우화료확증반응조건.종소시험적55주련매균중,균특이지확증출료상술4개기인적편단,병성공진행료서렬측정,험증료소설계인물적실용성.소귀납적인물설계방법가용우고(G+C)mol%혁란씨양성세균적기타간가기인,이촉진다기인계통진화연구적개전.
