基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2010年
6期
1064-1071
,共8页
马铃薯X病毒%完整基因组%微卫星%分布特性%最优完全子图算法
馬鈴藷X病毒%完整基因組%微衛星%分佈特性%最優完全子圖算法
마령서X병독%완정기인조%미위성%분포특성%최우완전자도산법
本文利用自编计算机程序提取并展示马铃薯X病毒完整基因组(NC_011620.1)上微卫星分布特性.借助MATLAB软件和借用最优完全子图算法,分析NCBI数据库中该基因组(NC_011620.1)微卫星分布特性.结果表明,计算出所有各种N-碱基组(N取1至6)在完整基因组序列上重复出现次数和出现位置,展示它们的分布规律(指数函数),马铃薯X病毒完整基因组(NC_011620.1)上各种N-碱基组最大的重复出现次数随N按指数函数数减少;且呈现出重复出现次数由少到多排序,重复出现次数随序号增加;本文使用的方法,可以系统地应用到其它病毒完整基因组序列微卫星分布特性分析,从而为有效利用微卫星分布特性研究完整基因组的结构和功能、遗传和变异规律提供完整的数据支撑.
本文利用自編計算機程序提取併展示馬鈴藷X病毒完整基因組(NC_011620.1)上微衛星分佈特性.藉助MATLAB軟件和藉用最優完全子圖算法,分析NCBI數據庫中該基因組(NC_011620.1)微衛星分佈特性.結果錶明,計算齣所有各種N-堿基組(N取1至6)在完整基因組序列上重複齣現次數和齣現位置,展示它們的分佈規律(指數函數),馬鈴藷X病毒完整基因組(NC_011620.1)上各種N-堿基組最大的重複齣現次數隨N按指數函數數減少;且呈現齣重複齣現次數由少到多排序,重複齣現次數隨序號增加;本文使用的方法,可以繫統地應用到其它病毒完整基因組序列微衛星分佈特性分析,從而為有效利用微衛星分佈特性研究完整基因組的結構和功能、遺傳和變異規律提供完整的數據支撐.
본문이용자편계산궤정서제취병전시마령서X병독완정기인조(NC_011620.1)상미위성분포특성.차조MATLAB연건화차용최우완전자도산법,분석NCBI수거고중해기인조(NC_011620.1)미위성분포특성.결과표명,계산출소유각충N-감기조(N취1지6)재완정기인조서렬상중복출현차수화출현위치,전시타문적분포규률(지수함수),마령서X병독완정기인조(NC_011620.1)상각충N-감기조최대적중복출현차수수N안지수함수수감소;차정현출중복출현차수유소도다배서,중복출현차수수서호증가;본문사용적방법,가이계통지응용도기타병독완정기인조서렬미위성분포특성분석,종이위유효이용미위성분포특성연구완정기인조적결구화공능、유전화변이규률제공완정적수거지탱.
