江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2011年
2期
29-34
,共6页
伊亚莉%关宁%张文娟%王涌鑫%苗丽宏%李聪
伊亞莉%關寧%張文娟%王湧鑫%苗麗宏%李聰
이아리%관저%장문연%왕용흠%묘려굉%리총
紫花苜蓿%几丁质酶基因%cDNA克隆%序列分析
紫花苜蓿%幾丁質酶基因%cDNA剋隆%序列分析
자화목숙%궤정질매기인%cDNA극륭%서렬분석
依据NCBI中已登录的截形首蓿(Medicago truncatula)几丁质酶基因的一段EST序列(GenBank登录号:AF167323)设计引物,以紫花苜蓿(Medicago sativa L.)为试验材料,利用RACE技术进行cDNA全长克隆.利用生物信息学软件对该序列进行分析得知:该基因全长1 132bp,其中含有1个930bp的开放阅读框,编码309个氨基酸.分子质量为33.538ku,等电点pI为5.258,是一个酸性蛋白且分泌到胞外.将该基因命名为MsChi I(GenBank登录号为HM224449).聚类分析显示:它与其他已知植物Class Ⅰ类几丁质酶基因具有高度的同源性;结构分析表明:该蛋白的二级结构中ρ螺旋、延伸链、β转角和无规则卷曲分别占25.89%、10.68%、4.21%、59.22%;功能分析可知:该蛋白为亲水性非跨膜蛋白,属于几丁质酶第19家族.
依據NCBI中已登錄的截形首蓿(Medicago truncatula)幾丁質酶基因的一段EST序列(GenBank登錄號:AF167323)設計引物,以紫花苜蓿(Medicago sativa L.)為試驗材料,利用RACE技術進行cDNA全長剋隆.利用生物信息學軟件對該序列進行分析得知:該基因全長1 132bp,其中含有1箇930bp的開放閱讀框,編碼309箇氨基痠.分子質量為33.538ku,等電點pI為5.258,是一箇痠性蛋白且分泌到胞外.將該基因命名為MsChi I(GenBank登錄號為HM224449).聚類分析顯示:它與其他已知植物Class Ⅰ類幾丁質酶基因具有高度的同源性;結構分析錶明:該蛋白的二級結構中ρ螺鏇、延伸鏈、β轉角和無規則捲麯分彆佔25.89%、10.68%、4.21%、59.22%;功能分析可知:該蛋白為親水性非跨膜蛋白,屬于幾丁質酶第19傢族.
의거NCBI중이등록적절형수숙(Medicago truncatula)궤정질매기인적일단EST서렬(GenBank등록호:AF167323)설계인물,이자화목숙(Medicago sativa L.)위시험재료,이용RACE기술진행cDNA전장극륭.이용생물신식학연건대해서렬진행분석득지:해기인전장1 132bp,기중함유1개930bp적개방열독광,편마309개안기산.분자질량위33.538ku,등전점pI위5.258,시일개산성단백차분비도포외.장해기인명명위MsChi I(GenBank등록호위HM224449).취류분석현시:타여기타이지식물Class Ⅰ류궤정질매기인구유고도적동원성;결구분석표명:해단백적이급결구중ρ라선、연신련、β전각화무규칙권곡분별점25.89%、10.68%、4.21%、59.22%;공능분석가지:해단백위친수성비과막단백,속우궤정질매제19가족.
