江西农业大学学报
江西農業大學學報
강서농업대학학보
ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS JIANGXIENSIS
2011年
3期
584-588
,共5页
分子建模%纤维素内切酶%食用菌
分子建模%纖維素內切酶%食用菌
분자건모%섬유소내절매%식용균
采用SWISS-MODEL、Discovery Studio等生物信息方法预测和分析食用菌纤维素内切酶(EG)分子的三级结构.结果显示:草菇(V.volvacea)和云芝(T.hirsuta)EG的分子外形呈“桶”状,由外层的alpha -螺旋和内层的beta-折叠组成,无规卷曲位于其2个底面；草菇EG的R129作为盐键形成中心,参与形成6个盐键,其催化残基E215和E248参与形成5个氢键,而里氏木霉(T.reesei) EG II的催化残基参与形成3个氢键.基于EG连接区和催化相关序列氢键分析,认为草菇和云芝的该区域相关碱基或氨基酸可进行突变和优化.目前未见对草菇和云芝EG的分子建模的研究报道.此研究对于食用菌纤维素内切酶结构的深入了解和结构优化及应用具有重要的意义和价值.
採用SWISS-MODEL、Discovery Studio等生物信息方法預測和分析食用菌纖維素內切酶(EG)分子的三級結構.結果顯示:草菇(V.volvacea)和雲芝(T.hirsuta)EG的分子外形呈“桶”狀,由外層的alpha -螺鏇和內層的beta-摺疊組成,無規捲麯位于其2箇底麵；草菇EG的R129作為鹽鍵形成中心,參與形成6箇鹽鍵,其催化殘基E215和E248參與形成5箇氫鍵,而裏氏木黴(T.reesei) EG II的催化殘基參與形成3箇氫鍵.基于EG連接區和催化相關序列氫鍵分析,認為草菇和雲芝的該區域相關堿基或氨基痠可進行突變和優化.目前未見對草菇和雲芝EG的分子建模的研究報道.此研究對于食用菌纖維素內切酶結構的深入瞭解和結構優化及應用具有重要的意義和價值.
채용SWISS-MODEL、Discovery Studio등생물신식방법예측화분석식용균섬유소내절매(EG)분자적삼급결구.결과현시:초고(V.volvacea)화운지(T.hirsuta)EG적분자외형정“통”상,유외층적alpha -라선화내층적beta-절첩조성,무규권곡위우기2개저면；초고EG적R129작위염건형성중심,삼여형성6개염건,기최화잔기E215화E248삼여형성5개경건,이리씨목매(T.reesei) EG II적최화잔기삼여형성3개경건.기우EG련접구화최화상관서렬경건분석,인위초고화운지적해구역상관감기혹안기산가진행돌변화우화.목전미견대초고화운지EG적분자건모적연구보도.차연구대우식용균섬유소내절매결구적심입료해화결구우화급응용구유중요적의의화개치.
