计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2005年
2期
81-84
,共4页
苏振强%徐佳维%蔡文生%邵学广
囌振彊%徐佳維%蔡文生%邵學廣
소진강%서가유%채문생%소학엄
计算网格%Globus Toolkit%SunTM ONE Grid Engine%计算机群
計算網格%Globus Toolkit%SunTM ONE Grid Engine%計算機群
계산망격%Globus Toolkit%SunTM ONE Grid Engine%계산궤군
网格计算(grid computing)是近几年发展起来的一个崭新研究领域,引起国内外学术界及工业界的广泛关注.其目的是研究如何安全有效地将现有的各种计算资源(尤其是那些分布在Internet的异构网络中的计算资源)组织起来协同解决复杂的科学及工程计算问题.在化学信息学和生物信息学中最典型的应用是虚拟高通量筛选侯选药物分子.本文以两个Linux机群为基础,用开放源码的网格支持软件包Globus Toolkit 3.2及SunTM ONE Grid Engine 5.3成功构建了计算网格;并通过设计测试程序实现一次性提交多个作业(300个)以及分析作业在计算网格中各个节点的分配及运行情况,从而测试了计算网格的效率.结果表明,所构建的计算网格在保持原机群运行稳定、可靠的前提下,改进了系统资源的分配管理方式以及用户提交作业的方法,从整体上提高了网络计算资源的利用率,也同时方便了系统的管理.
網格計算(grid computing)是近幾年髮展起來的一箇嶄新研究領域,引起國內外學術界及工業界的廣汎關註.其目的是研究如何安全有效地將現有的各種計算資源(尤其是那些分佈在Internet的異構網絡中的計算資源)組織起來協同解決複雜的科學及工程計算問題.在化學信息學和生物信息學中最典型的應用是虛擬高通量篩選侯選藥物分子.本文以兩箇Linux機群為基礎,用開放源碼的網格支持軟件包Globus Toolkit 3.2及SunTM ONE Grid Engine 5.3成功構建瞭計算網格;併通過設計測試程序實現一次性提交多箇作業(300箇)以及分析作業在計算網格中各箇節點的分配及運行情況,從而測試瞭計算網格的效率.結果錶明,所構建的計算網格在保持原機群運行穩定、可靠的前提下,改進瞭繫統資源的分配管理方式以及用戶提交作業的方法,從整體上提高瞭網絡計算資源的利用率,也同時方便瞭繫統的管理.
망격계산(grid computing)시근궤년발전기래적일개참신연구영역,인기국내외학술계급공업계적엄범관주.기목적시연구여하안전유효지장현유적각충계산자원(우기시나사분포재Internet적이구망락중적계산자원)조직기래협동해결복잡적과학급공정계산문제.재화학신식학화생물신식학중최전형적응용시허의고통량사선후선약물분자.본문이량개Linux궤군위기출,용개방원마적망격지지연건포Globus Toolkit 3.2급SunTM ONE Grid Engine 5.3성공구건료계산망격;병통과설계측시정서실현일차성제교다개작업(300개)이급분석작업재계산망격중각개절점적분배급운행정황,종이측시료계산망격적효솔.결과표명,소구건적계산망격재보지원궤군운행은정、가고적전제하,개진료계통자원적분배관리방식이급용호제교작업적방법,종정체상제고료망락계산자원적이용솔,야동시방편료계통적관리.