微生物学免疫学进展
微生物學免疫學進展
미생물학면역학진전
PROGRESS IN MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY
2008年
3期
1-6
,共6页
刘杨安%赵卫%赖沛龙%卢扬柏%朱利%张玲
劉楊安%趙衛%賴沛龍%盧颺柏%硃利%張玲
류양안%조위%뢰패룡%로양백%주리%장령
H5N1%血凝素基因(HA)%分子进化分析
H5N1%血凝素基因(HA)%分子進化分析
H5N1%혈응소기인(HA)%분자진화분석
为了阐明中国H5N1禽流感病毒血凝素(HA)基因的分子进化规律,从GenBank下载中国近年来分离的27株禽流感H5N1病毒的HA基因,利用LaserGene软件包中的EditSeq程序剪切共同序列并翻译成氨基酸序列,与DNAMAN软件进行比对,并以LaserGene软件包中的MegAlign程序构建分子进化树,结合背景资料分析其传播流行规律.结果显示: ①在HA裂解位点上游毗邻的位置,gdch04、gddu04、gxch0405、gxdu05、gxqu0502、hkcph05、stch05、stqu05、ynch0502株都缺失了三个碱基;②27株毒株在HA裂解位点上游毗邻的位置存在多个连续的碱性氨基酸;③来自广西的gxch0405、gxdu05、gxqu0502和来自香港的hkcph05、hkgh04的序列同源性很高,很可能与苍鹭的迁移有关;④来自广西的gxqu0502和来自香港的hkcph05亲源关系很近,很可能来自同一祖先.
為瞭闡明中國H5N1禽流感病毒血凝素(HA)基因的分子進化規律,從GenBank下載中國近年來分離的27株禽流感H5N1病毒的HA基因,利用LaserGene軟件包中的EditSeq程序剪切共同序列併翻譯成氨基痠序列,與DNAMAN軟件進行比對,併以LaserGene軟件包中的MegAlign程序構建分子進化樹,結閤揹景資料分析其傳播流行規律.結果顯示: ①在HA裂解位點上遊毗鄰的位置,gdch04、gddu04、gxch0405、gxdu05、gxqu0502、hkcph05、stch05、stqu05、ynch0502株都缺失瞭三箇堿基;②27株毒株在HA裂解位點上遊毗鄰的位置存在多箇連續的堿性氨基痠;③來自廣西的gxch0405、gxdu05、gxqu0502和來自香港的hkcph05、hkgh04的序列同源性很高,很可能與蒼鷺的遷移有關;④來自廣西的gxqu0502和來自香港的hkcph05親源關繫很近,很可能來自同一祖先.
위료천명중국H5N1금류감병독혈응소(HA)기인적분자진화규률,종GenBank하재중국근년래분리적27주금류감H5N1병독적HA기인,이용LaserGene연건포중적EditSeq정서전절공동서렬병번역성안기산서렬,여DNAMAN연건진행비대,병이LaserGene연건포중적MegAlign정서구건분자진화수,결합배경자료분석기전파류행규률.결과현시: ①재HA렬해위점상유비린적위치,gdch04、gddu04、gxch0405、gxdu05、gxqu0502、hkcph05、stch05、stqu05、ynch0502주도결실료삼개감기;②27주독주재HA렬해위점상유비린적위치존재다개련속적감성안기산;③래자엄서적gxch0405、gxdu05、gxqu0502화래자향항적hkcph05、hkgh04적서렬동원성흔고,흔가능여창로적천이유관;④래자엄서적gxqu0502화래자향항적hkcph05친원관계흔근,흔가능래자동일조선.
