山地农业生物学报
山地農業生物學報
산지농업생물학보
JOURNAL OF MOUNTAIN AGRICULTURE AND BIOLOGY
2011年
2期
136-140
,共5页
高颖%代淑燕%张荷%程振涛%周碧君%文明
高穎%代淑燕%張荷%程振濤%週碧君%文明
고영%대숙연%장하%정진도%주벽군%문명
鸭肠炎病毒%核衣壳蛋白%密码子偏爱性
鴨腸炎病毒%覈衣殼蛋白%密碼子偏愛性
압장염병독%핵의각단백%밀마자편애성
为给鸭肠炎病毒(DEV)核衣壳蛋白(NP)基因选择良好的宿主表达系统提供参考依据,本研究运用EMBOSS软件包CHIPS和CUSP程序对DEV NP基因进行了密码子偏爱性分析.结果显示,DEV NP基因的ENC值为51.180,编码NP蛋白的A、I等氨基酸不同密码子的使用频率存在一定的差异;从与DEV NP基因密码子使用频率比值上看,大肠杆菌22个、酵母18个、鸭12个和人20个密码子存在较大的偏爱性.由此可见,编码DEV NP蛋白密码子出现频率较均一,且酵母等真核生物与其密码子偏爱性较为接近,可作为该基因体外表达宿主的首选.
為給鴨腸炎病毒(DEV)覈衣殼蛋白(NP)基因選擇良好的宿主錶達繫統提供參攷依據,本研究運用EMBOSS軟件包CHIPS和CUSP程序對DEV NP基因進行瞭密碼子偏愛性分析.結果顯示,DEV NP基因的ENC值為51.180,編碼NP蛋白的A、I等氨基痠不同密碼子的使用頻率存在一定的差異;從與DEV NP基因密碼子使用頻率比值上看,大腸桿菌22箇、酵母18箇、鴨12箇和人20箇密碼子存在較大的偏愛性.由此可見,編碼DEV NP蛋白密碼子齣現頻率較均一,且酵母等真覈生物與其密碼子偏愛性較為接近,可作為該基因體外錶達宿主的首選.
위급압장염병독(DEV)핵의각단백(NP)기인선택량호적숙주표체계통제공삼고의거,본연구운용EMBOSS연건포CHIPS화CUSP정서대DEV NP기인진행료밀마자편애성분석.결과현시,DEV NP기인적ENC치위51.180,편마NP단백적A、I등안기산불동밀마자적사용빈솔존재일정적차이;종여DEV NP기인밀마자사용빈솔비치상간,대장간균22개、효모18개、압12개화인20개밀마자존재교대적편애성.유차가견,편마DEV NP단백밀마자출현빈솔교균일,차효모등진핵생물여기밀마자편애성교위접근,가작위해기인체외표체숙주적수선.
