CAJ | 학술논문

以福建农林大学菌物研究中心保存的草菇单孢菌株PYd21、PYd15及二者的杂交配对异核菌株H15-21为研究材料,利用本中心草菇的基因组、转录组及表达谱测序数据,对草菇磷酸甘油酸变位酶(PGAM)基因进行基因克隆,并对其结构与表达量进行研究.克隆测序了PYd21与PYd15中PGAM基因并进行比对,比对结果表明2个菌株的PGAM基因序列一致.利用转录组数据对PGAM基因结构进行分析,分析结果显示:该基因全长2 118 bp,含有10个外显子、9个内含子,其中6个内含子存在内含子保留的可变剪切类型;开放阅读框(ORF)全长1 611 bp、编码536个氨基酸.数字基因表达谱分析结果表明,PGAM基因在PYd21、PYd15及H15-21中的标准表达量分别为35.29、127.91、302.89 TPM (Transcript Per Million Clean Tags),表达量依次升高,与菌丝生长速度显著正相关,且异核菌株H15-21中的表达量显著高于2个单孢菌株,暗示了异核体H15-21中两种不同的细胞核存在相互作用,影响了PGAM基因的表达.采用实时荧光定量PCR技术对基因表达量进行验证,与表达谱数据相符合.
이복건농림대학균물연구중심보존적초고단포균주PYd21、PYd15급이자적잡교배대이핵균주H15-21위연구재료,이용본중심초고적기인조、전록조급표체보측서수거,대초고린산감유산변위매(PGAM)기인진행기인극륭,병대기결구여표체량진행연구.극륭측서료PYd21여PYd15중PGAM기인병진행비대,비대결과표명2개균주적PGAM기인서렬일치.이용전록조수거대PGAM기인결구진행분석,분석결과현시:해기인전장2 118 bp,함유10개외현자、9개내함자,기중6개내함자존재내함자보류적가변전절류형;개방열독광(ORF)전장1 611 bp、편마536개안기산.수자기인표체보분석결과표명,PGAM기인재PYd21、PYd15급H15-21중적표준표체량분별위35.29、127.91、302.89 TPM (Transcript Per Million Clean Tags),표체량의차승고,여균사생장속도현저정상관,차이핵균주H15-21중적표체량현저고우2개단포균주,암시료이핵체H15-21중량충불동적세포핵존재상호작용,영향료PGAM기인적표체.채용실시형광정량PCR기술대기인표체량진행험증,여표체보수거상부합.