作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2006年
12期
1836-1840
,共5页
毛新国%汤继凤%周荣华%景蕊莲%贾继增
毛新國%湯繼鳳%週榮華%景蕊蓮%賈繼增
모신국%탕계봉%주영화%경예련%가계증
单核苷酸多态性%基因组供体%转换%颠换%单体型
單覈苷痠多態性%基因組供體%轉換%顛換%單體型
단핵감산다태성%기인조공체%전환%전환%단체형
以测序得到的来自小麦不同基因组的基因序列为源序列,用AutoSNP软件,在GenBank中的小麦EST库中检测到一批cSNP,开辟了一条发掘小麦基因组特异候选cSNP的新途径.在2089个源序列中,检测到1 296个cSNP,其中有397个来自A基因组,322个来自S基因组,420个来自D基因组;另外,A和D基因组共有的SNP有154个,A和S,S和D,A、S和D基因组共有的SNP各仅有1个,这一结果也同时表明,小麦的3个基因组供体种中,A、D基因组关系比较近,而它们与S基因组的关系比较远.统计分析表明,小麦中SNP出现的频率约为0.914‰.
以測序得到的來自小麥不同基因組的基因序列為源序列,用AutoSNP軟件,在GenBank中的小麥EST庫中檢測到一批cSNP,開闢瞭一條髮掘小麥基因組特異候選cSNP的新途徑.在2089箇源序列中,檢測到1 296箇cSNP,其中有397箇來自A基因組,322箇來自S基因組,420箇來自D基因組;另外,A和D基因組共有的SNP有154箇,A和S,S和D,A、S和D基因組共有的SNP各僅有1箇,這一結果也同時錶明,小麥的3箇基因組供體種中,A、D基因組關繫比較近,而它們與S基因組的關繫比較遠.統計分析錶明,小麥中SNP齣現的頻率約為0.914‰.
이측서득도적래자소맥불동기인조적기인서렬위원서렬,용AutoSNP연건,재GenBank중적소맥EST고중검측도일비cSNP,개벽료일조발굴소맥기인조특이후선cSNP적신도경.재2089개원서렬중,검측도1 296개cSNP,기중유397개래자A기인조,322개래자S기인조,420개래자D기인조;령외,A화D기인조공유적SNP유154개,A화S,S화D,A、S화D기인조공유적SNP각부유1개,저일결과야동시표명,소맥적3개기인조공체충중,A、D기인조관계비교근,이타문여S기인조적관계비교원.통계분석표명,소맥중SNP출현적빈솔약위0.914‰.
