遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2009年
4期
365-373
,共9页
侯琳%钱敏平%朱云平%邓明华
侯琳%錢敏平%硃雲平%鄧明華
후림%전민평%주운평%산명화
转录因子结合位点%生物信息学%ChIP-chip%位置权重矩阵%系统发育足迹分析法
轉錄因子結閤位點%生物信息學%ChIP-chip%位置權重矩陣%繫統髮育足跡分析法
전록인자결합위점%생물신식학%ChIP-chip%위치권중구진%계통발육족적분석법
转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程.确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题.随着高通量实验技术的发展,结合ChIP-chip实验以及多个基因组的序列信息来预测TFBS已成为新的研究热点.本文简要概述了用于TFBS定位的实验技术,TFBS信息相关的数据库,重点评述了描述TFBS的模型以及预测TFBS的多种软件.TFBS的生物信息学研究的发展,将与相关领域相互促进,有助于进一步揭示转录调控机制.
轉錄因子結閤位點(Transcription factor binding site,TFBS)是與轉錄因子結閤的DNA序列,它們與轉錄因子相互作用調控基因的轉錄過程.確定TFBS是理解轉錄調控機製,建立轉錄調控網絡的關鍵問題.隨著高通量實驗技術的髮展,結閤ChIP-chip實驗以及多箇基因組的序列信息來預測TFBS已成為新的研究熱點.本文簡要概述瞭用于TFBS定位的實驗技術,TFBS信息相關的數據庫,重點評述瞭描述TFBS的模型以及預測TFBS的多種軟件.TFBS的生物信息學研究的髮展,將與相關領域相互促進,有助于進一步揭示轉錄調控機製.
전록인자결합위점(Transcription factor binding site,TFBS)시여전록인자결합적DNA서렬,타문여전록인자상호작용조공기인적전록과정.학정TFBS시리해전록조공궤제,건립전록조공망락적관건문제.수착고통량실험기술적발전,결합ChIP-chip실험이급다개기인조적서렬신식래예측TFBS이성위신적연구열점.본문간요개술료용우TFBS정위적실험기술,TFBS신식상관적수거고,중점평술료묘술TFBS적모형이급예측TFBS적다충연건.TFBS적생물신식학연구적발전,장여상관영역상호촉진,유조우진일보게시전록조공궤제.