计算机应用
計算機應用
계산궤응용
COMPUTER APPLICATION
2010年
6期
1687-1689
,共3页
李鸿健%白明泽%唐红%孙世新
李鴻健%白明澤%唐紅%孫世新
리홍건%백명택%당홍%손세신
半经典分子动力学%混合并行技术%SMP集群%双层并行
半經典分子動力學%混閤併行技術%SMP集群%雙層併行
반경전분자동역학%혼합병행기술%SMP집군%쌍층병행
为提高激光化学反应模拟效率,在半经典分子动力学模拟中引入混合并行技术和双层并行思想.基于MPI+OpenMP混合模型设计并实现激光化学反应双层并行模拟算法,上层基于MPI实现节点间的原子分解并行,下层基于OpenMP实现节点内的多线程矩阵并行乘法.在SMP集群中测试表明,模拟大分子体系激光化学反应并行效率可达60%以上.因此,应用混合并行技术可有效提高激光化学反应模拟效率.
為提高激光化學反應模擬效率,在半經典分子動力學模擬中引入混閤併行技術和雙層併行思想.基于MPI+OpenMP混閤模型設計併實現激光化學反應雙層併行模擬算法,上層基于MPI實現節點間的原子分解併行,下層基于OpenMP實現節點內的多線程矩陣併行乘法.在SMP集群中測試錶明,模擬大分子體繫激光化學反應併行效率可達60%以上.因此,應用混閤併行技術可有效提高激光化學反應模擬效率.
위제고격광화학반응모의효솔,재반경전분자동역학모의중인입혼합병행기술화쌍층병행사상.기우MPI+OpenMP혼합모형설계병실현격광화학반응쌍층병행모의산법,상층기우MPI실현절점간적원자분해병행,하층기우OpenMP실현절점내적다선정구진병행승법.재SMP집군중측시표명,모의대분자체계격광화학반응병행효솔가체60%이상.인차,응용혼합병행기술가유효제고격광화학반응모의효솔.
