CAJ | 학술논문

手性对映体分子的物理化学性质基本相同,其旋光性差异直接影响生物体内生理和药理的活性.本文以Builder和Discover-3模块为基础,在InsightⅡ平台上模建并优化,采用Dock刚性、柔性对接及GOLD柔性对接的方法,模拟了β-环糊精识别手性对映体的能力.通过利用DMS程序计算环糊精分子溶剂的可接触表面,用SPHGEN程序计算,产生球集,形成环糊精分子活性位点的负像;在环糊精分子上打格点,计算格点能;采用格点的打分函数打分,分子对接,保存分数最高的对接结果等步骤;表明手性识别的预测率从高到低依次是GOLD对接,Dock柔性对接,Dock刚性对接.由于刚性对接过程对映体分子保持刚性,导致手性识别效果最差,故分子柔性的作用不可忽视;GOLD对接在模拟环糊精对对映体手性识别方面要优于Dock对接模拟.因此,用GOLD对接建立了β-环糊精对对映体的手性识别模型,结合能越大,相互作用越强,形成的包合物越稳定.分析模型的结合能组分,以分子识别过程中的氢键作用为模型,则其手性识别预测结果正确率为45.5%:如以分子间氢键作用和范德华作用为预测模型,则其预测正确率为81.8%.表明手性识别的驱动力不仅有氢键的作用,也存在范德华力的作用.
수성대영체분자적물이화학성질기본상동,기선광성차이직접영향생물체내생리화약리적활성.본문이Builder화Discover-3모괴위기출,재InsightⅡ평태상모건병우화,채용Dock강성、유성대접급GOLD유성대접적방법,모의료β-배호정식별수성대영체적능력.통과이용DMS정서계산배호정분자용제적가접촉표면,용SPHGEN정서계산,산생구집,형성배호정분자활성위점적부상;재배호정분자상타격점,계산격점능;채용격점적타분함수타분,분자대접,보존분수최고적대접결과등보취;표명수성식별적예측솔종고도저의차시GOLD대접,Dock유성대접,Dock강성대접.유우강성대접과정대영체분자보지강성,도치수성식별효과최차,고분자유성적작용불가홀시;GOLD대접재모의배호정대대영체수성식별방면요우우Dock대접모의.인차,용GOLD대접건립료β-배호정대대영체적수성식별모형,결합능월대,상호작용월강,형성적포합물월은정.분석모형적결합능조분,이분자식별과정중적경건작용위모형,칙기수성식별예측결과정학솔위45.5%:여이분자간경건작용화범덕화작용위예측모형,칙기예측정학솔위81.8%.표명수성식별적구동력불부유경건적작용,야존재범덕화력적작용.