中国糖料
中國糖料
중국당료
SUGAR CROPS OF CHINA
2011年
3期
1-5
,共5页
史树德%魏磊%张子义%邵金旺%田自华
史樹德%魏磊%張子義%邵金旺%田自華
사수덕%위뢰%장자의%소금왕%전자화
甜菜%微卫星%表达序列标签%遗传多样性
甜菜%微衛星%錶達序列標籤%遺傳多樣性
첨채%미위성%표체서렬표첨%유전다양성
利用NCBI公共数据库现有的甜菜(Beta vulgaris L.)表达序列标签(expressed sequence tags,EST)数据信息,开发了甜菜EST-SSR标记.在所有的29830条甜菜EST序列中共确认得到20109条非冗余EST序列,总长为11287.6kb.在含有微卫星重复的6951条EST序列中按照SSR引物设计要求,最终获得了2845个EST-SSR,平均每3.96 kb含有1个SSR.EST-SSR的分布频率和特征分析表明,A/T单碱基重复最多,其次是AAG/CTT三核苷酸重复,AG/CT二核苷酸重复,ACCTCC/AGGTGG等六核苷酸重复最少.随机合成了100对SSR引物,并分别选用6个甜菜品种进行多态性检验,将其按遗传相似性分为两组,多态信息含量(polymorphism information content,PIC)平均值为0.47.本研究证实这种全新的开发甜菜SSR标记的方法具有高效、多态性较高的特点,在甜菜遗传多样性分析、功能基因定位、遗传图谱构建以及比较基因组等研究方面有广阔的利用前景.
利用NCBI公共數據庫現有的甜菜(Beta vulgaris L.)錶達序列標籤(expressed sequence tags,EST)數據信息,開髮瞭甜菜EST-SSR標記.在所有的29830條甜菜EST序列中共確認得到20109條非冗餘EST序列,總長為11287.6kb.在含有微衛星重複的6951條EST序列中按照SSR引物設計要求,最終穫得瞭2845箇EST-SSR,平均每3.96 kb含有1箇SSR.EST-SSR的分佈頻率和特徵分析錶明,A/T單堿基重複最多,其次是AAG/CTT三覈苷痠重複,AG/CT二覈苷痠重複,ACCTCC/AGGTGG等六覈苷痠重複最少.隨機閤成瞭100對SSR引物,併分彆選用6箇甜菜品種進行多態性檢驗,將其按遺傳相似性分為兩組,多態信息含量(polymorphism information content,PIC)平均值為0.47.本研究證實這種全新的開髮甜菜SSR標記的方法具有高效、多態性較高的特點,在甜菜遺傳多樣性分析、功能基因定位、遺傳圖譜構建以及比較基因組等研究方麵有廣闊的利用前景.
이용NCBI공공수거고현유적첨채(Beta vulgaris L.)표체서렬표첨(expressed sequence tags,EST)수거신식,개발료첨채EST-SSR표기.재소유적29830조첨채EST서렬중공학인득도20109조비용여EST서렬,총장위11287.6kb.재함유미위성중복적6951조EST서렬중안조SSR인물설계요구,최종획득료2845개EST-SSR,평균매3.96 kb함유1개SSR.EST-SSR적분포빈솔화특정분석표명,A/T단감기중복최다,기차시AAG/CTT삼핵감산중복,AG/CT이핵감산중복,ACCTCC/AGGTGG등륙핵감산중복최소.수궤합성료100대SSR인물,병분별선용6개첨채품충진행다태성검험,장기안유전상사성분위량조,다태신식함량(polymorphism information content,PIC)평균치위0.47.본연구증실저충전신적개발첨채SSR표기적방법구유고효、다태성교고적특점,재첨채유전다양성분석、공능기인정위、유전도보구건이급비교기인조등연구방면유엄활적이용전경.
