东南大学学报（自然科学版）
東南大學學報（自然科學版）
동남대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SOUTHEAST UNIVERSITY
2011年
6期
1219-1224
,共6页
线形DNA分子链%珠-弹簧模型%非线性作用%布朗动力学模拟%回旋半径%扩散系数
線形DNA分子鏈%珠-彈簧模型%非線性作用%佈朗動力學模擬%迴鏇半徑%擴散繫數
선형DNA분자련%주-탄황모형%비선성작용%포랑동역학모의%회선반경%확산계수
通过构建全参数化的珠一弹簧分子链模型,并运用一种高效稳定的半隐式预测-校验积分算法求解描述稀溶液中DNA分子链结构演化的随机动力学方程组,系统研究了体积排斥作用、有限伸长弹性作用和涨落流体动力学作用对分子链的回旋半径、质心扩散系数以及相应标度指数的影响.模拟结果能够验证良溶剂中分子链Zimm模型的标度规律,并揭示出3种非线性作用对稀溶液中分子链静态结构属性和动力学属性不同的影响程度和变化趋势.分子链柔性对稀溶液中DNA结构、扩散系数以及标度指数影响都很小.溶剂品质的提高可显著增大分子链的回旋半径,减小其扩散系数,并且使两者随链长的标度指数显著增加.流体动力学作用不改变分子链的结构,但显著影响其扩散系数.随着流体作用的增强,分子链的质心扩散系数增大,随链长变化的标度指数减小.
通過構建全參數化的珠一彈簧分子鏈模型,併運用一種高效穩定的半隱式預測-校驗積分算法求解描述稀溶液中DNA分子鏈結構縯化的隨機動力學方程組,繫統研究瞭體積排斥作用、有限伸長彈性作用和漲落流體動力學作用對分子鏈的迴鏇半徑、質心擴散繫數以及相應標度指數的影響.模擬結果能夠驗證良溶劑中分子鏈Zimm模型的標度規律,併揭示齣3種非線性作用對稀溶液中分子鏈靜態結構屬性和動力學屬性不同的影響程度和變化趨勢.分子鏈柔性對稀溶液中DNA結構、擴散繫數以及標度指數影響都很小.溶劑品質的提高可顯著增大分子鏈的迴鏇半徑,減小其擴散繫數,併且使兩者隨鏈長的標度指數顯著增加.流體動力學作用不改變分子鏈的結構,但顯著影響其擴散繫數.隨著流體作用的增彊,分子鏈的質心擴散繫數增大,隨鏈長變化的標度指數減小.
통과구건전삼수화적주일탄황분자련모형,병운용일충고효은정적반은식예측-교험적분산법구해묘술희용액중DNA분자련결구연화적수궤동역학방정조,계통연구료체적배척작용、유한신장탄성작용화창락류체동역학작용대분자련적회선반경、질심확산계수이급상응표도지수적영향.모의결과능구험증량용제중분자련Zimm모형적표도규률,병게시출3충비선성작용대희용액중분자련정태결구속성화동역학속성불동적영향정도화변화추세.분자련유성대희용액중DNA결구、확산계수이급표도지수영향도흔소.용제품질적제고가현저증대분자련적회선반경,감소기확산계수,병차사량자수련장적표도지수현저증가.류체동역학작용불개변분자련적결구,단현저영향기확산계수.수착류체작용적증강,분자련적질심확산계수증대,수련장변화적표도지수감소.
