军事医学
軍事醫學
군사의학
BULLETIN OF THE ACADEMY OF MILITARY MEDICAL SCIENCES
2012年
4期
267-271,275
,共6页
张颖%胡亚欧%何涛%侯小强%汪莉%张部昌%王玉民
張穎%鬍亞歐%何濤%侯小彊%汪莉%張部昌%王玉民
장영%호아구%하도%후소강%왕리%장부창%왕옥민
GLI1%编码区%A-to-I RNA编辑%生物信息学%肿瘤
GLI1%編碼區%A-to-I RNA編輯%生物信息學%腫瘤
GLI1%편마구%A-to-I RNA편집%생물신식학%종류
目的 检测癌相关基因GLI1编码区发生的A-to-I RNA编辑,比较编辑水平在肿瘤与正常细胞系中的差异,并分析编辑事件的潜在影响,以期揭示其与癌症发生发展的关联.方法 通过PCR、RT-PCR及测序的方法检测GLI1编码区DNA和RNA序列上的差异,以此来识别该区域上的A-to-I RNA编辑事件和比较肿瘤与正常细胞系中编辑位点的编辑水平差异.使用多种生物信息学工具分析编辑事件的潜在功能影响.结果 在人脑、乳腺、小肠组织及多种细胞系中均检测到GLI1转录本上对应染色体12∶56150891的位置发生A-to-I RNA编辑,该编辑事件导致GLI1第701位氨基酸由精氨酸转变为谷氨酸.与相应的正常细胞系相比,肝癌细胞系及乳腺癌细胞系中该位点的编辑水平明显降低.生物信息学分析表明此编辑事件能改变编码的氨基酸,并可能破坏外显子剪接增强子及影响蛋白质高级结构.结论 GLI1编码区发生的A-to-I RNA编辑在人脑、乳腺、小肠组织及多种细胞系中普遍存在.该编辑事件在肝癌和乳腺癌细胞系中的下调提示其可能与癌症的发生发展相关.
目的 檢測癌相關基因GLI1編碼區髮生的A-to-I RNA編輯,比較編輯水平在腫瘤與正常細胞繫中的差異,併分析編輯事件的潛在影響,以期揭示其與癌癥髮生髮展的關聯.方法 通過PCR、RT-PCR及測序的方法檢測GLI1編碼區DNA和RNA序列上的差異,以此來識彆該區域上的A-to-I RNA編輯事件和比較腫瘤與正常細胞繫中編輯位點的編輯水平差異.使用多種生物信息學工具分析編輯事件的潛在功能影響.結果 在人腦、乳腺、小腸組織及多種細胞繫中均檢測到GLI1轉錄本上對應染色體12∶56150891的位置髮生A-to-I RNA編輯,該編輯事件導緻GLI1第701位氨基痠由精氨痠轉變為穀氨痠.與相應的正常細胞繫相比,肝癌細胞繫及乳腺癌細胞繫中該位點的編輯水平明顯降低.生物信息學分析錶明此編輯事件能改變編碼的氨基痠,併可能破壞外顯子剪接增彊子及影響蛋白質高級結構.結論 GLI1編碼區髮生的A-to-I RNA編輯在人腦、乳腺、小腸組織及多種細胞繫中普遍存在.該編輯事件在肝癌和乳腺癌細胞繫中的下調提示其可能與癌癥的髮生髮展相關.
목적 검측암상관기인GLI1편마구발생적A-to-I RNA편집,비교편집수평재종류여정상세포계중적차이,병분석편집사건적잠재영향,이기게시기여암증발생발전적관련.방법 통과PCR、RT-PCR급측서적방법검측GLI1편마구DNA화RNA서렬상적차이,이차래식별해구역상적A-to-I RNA편집사건화비교종류여정상세포계중편집위점적편집수평차이.사용다충생물신식학공구분석편집사건적잠재공능영향.결과 재인뇌、유선、소장조직급다충세포계중균검측도GLI1전록본상대응염색체12∶56150891적위치발생A-to-I RNA편집,해편집사건도치GLI1제701위안기산유정안산전변위곡안산.여상응적정상세포계상비,간암세포계급유선암세포계중해위점적편집수평명현강저.생물신식학분석표명차편집사건능개변편마적안기산,병가능파배외현자전접증강자급영향단백질고급결구.결론 GLI1편마구발생적A-to-I RNA편집재인뇌、유선、소장조직급다충세포계중보편존재.해편집사건재간암화유선암세포계중적하조제시기가능여암증적발생발전상관.
