微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2003年
6期
805-808
,共4页
禹胄%李涛%蔡涛%赵进东%罗静初
禹冑%李濤%蔡濤%趙進東%囉靜初
우주%리도%채도%조진동%라정초
微生物基因组%基因组注释%生物信息学%蓝细菌%数据库
微生物基因組%基因組註釋%生物信息學%藍細菌%數據庫
미생물기인조%기인조주석%생물신식학%람세균%수거고
利用生物信息学方法和工具开发了微生物基因组注释系统(Microbial genome annotation package, MGAP),并用于蓝细菌PCC7002的基因组注释.该系统由基因组注释系统和基于Web的用户接口程序两部分组成.基因组注释系统整合多个基因识别、功能预测和序列分析软件;以及蛋白质序列数据库、蛋白质资源信息系统和直系同源蛋白质家族数据库等.用户接口程序包括基因组环状图展示、基因和开放读码框在染色体上的分布图,以及注释信息检索工具.该系统基于PC微机和Linux操作系统,用MySQL作数据库管理系统、用Apache作Web服务器程序,用Perl脚本语言编写应用程序接口,上述软件均可免费获得.
利用生物信息學方法和工具開髮瞭微生物基因組註釋繫統(Microbial genome annotation package, MGAP),併用于藍細菌PCC7002的基因組註釋.該繫統由基因組註釋繫統和基于Web的用戶接口程序兩部分組成.基因組註釋繫統整閤多箇基因識彆、功能預測和序列分析軟件;以及蛋白質序列數據庫、蛋白質資源信息繫統和直繫同源蛋白質傢族數據庫等.用戶接口程序包括基因組環狀圖展示、基因和開放讀碼框在染色體上的分佈圖,以及註釋信息檢索工具.該繫統基于PC微機和Linux操作繫統,用MySQL作數據庫管理繫統、用Apache作Web服務器程序,用Perl腳本語言編寫應用程序接口,上述軟件均可免費穫得.
이용생물신식학방법화공구개발료미생물기인조주석계통(Microbial genome annotation package, MGAP),병용우람세균PCC7002적기인조주석.해계통유기인조주석계통화기우Web적용호접구정서량부분조성.기인조주석계통정합다개기인식별、공능예측화서렬분석연건;이급단백질서렬수거고、단백질자원신식계통화직계동원단백질가족수거고등.용호접구정서포괄기인조배상도전시、기인화개방독마광재염색체상적분포도,이급주석신식검색공구.해계통기우PC미궤화Linux조작계통,용MySQL작수거고관리계통、용Apache작Web복무기정서,용Perl각본어언편사응용정서접구,상술연건균가면비획득.
