计算机系统应用
計算機繫統應用
계산궤계통응용
APPLICATIONS OF THE COMPUTER SYSTEMS
2011年
3期
169-172,209
,共5页
桌面网格计算%计算模型%序列比对%生物信息学%并行计算
桌麵網格計算%計算模型%序列比對%生物信息學%併行計算
탁면망격계산%계산모형%서렬비대%생물신식학%병행계산
提出了一种多序列比对ClustalW算法并行化处理的新方法ParaClustalW,该方法使用桌面网格计算平台作为高性能编程环境和运行平台.分析了多序列比对算法在桌面网格平台上的任务划分方式、并行化策略和实现技术.ParaClustalW策略考虑到序列的数目与序列的长度等因素,实现任务划分的均衡性.经实验证明,ParaClustalW方法具有较好的计算速度和加速比,在同等机器配置下,优于当前的一些计算方法,对多序列比对算法的研究具有参考价值.
提齣瞭一種多序列比對ClustalW算法併行化處理的新方法ParaClustalW,該方法使用桌麵網格計算平檯作為高性能編程環境和運行平檯.分析瞭多序列比對算法在桌麵網格平檯上的任務劃分方式、併行化策略和實現技術.ParaClustalW策略攷慮到序列的數目與序列的長度等因素,實現任務劃分的均衡性.經實驗證明,ParaClustalW方法具有較好的計算速度和加速比,在同等機器配置下,優于噹前的一些計算方法,對多序列比對算法的研究具有參攷價值.
제출료일충다서렬비대ClustalW산법병행화처리적신방법ParaClustalW,해방법사용탁면망격계산평태작위고성능편정배경화운행평태.분석료다서렬비대산법재탁면망격평태상적임무화분방식、병행화책략화실현기술.ParaClustalW책략고필도서렬적수목여서렬적장도등인소,실현임무화분적균형성.경실험증명,ParaClustalW방법구유교호적계산속도화가속비,재동등궤기배치하,우우당전적일사계산방법,대다서렬비대산법적연구구유삼고개치.
