上海交通大学学报（农业科学版）
上海交通大學學報（農業科學版）
상해교통대학학보（농업과학판）
JOURNAL OF SHANGHAI JIAOTONG UNIVERSITY(AGRICULTURAL SCIENCE)
2009年
2期
101-107
,共7页
王旭荣%张彩勤%赵炳武%张春红%杨增岐%宋长绪
王旭榮%張綵勤%趙炳武%張春紅%楊增岐%宋長緒
왕욱영%장채근%조병무%장춘홍%양증기%송장서
猪繁殖与呼吸综合征病毒%Jiangxi-3%全基因组%序列分析
豬繁殖與呼吸綜閤徵病毒%Jiangxi-3%全基因組%序列分析
저번식여호흡종합정병독%Jiangxi-3%전기인조%서렬분석
通过RT-PCR分段扩增PRRSV流行株Jiangxi-3的基因组,参照VR2332序列,根据各片段之间相重叠的区域,将扩增片段的序列依次拼接获得Jiangxi-3完整的全基因组,并通过DNAStar软件对其进行分析.结果表明:Jiangxi-3的Nsp2推导氨基酸发生30个氨基酸的不连续缺失,与HB-1(sh)/2002相比,Nsp2推导的第480位氨基酸由D突变为E,缺失的位置为第481位氨基酸和532～560位氨基酸;Jiangxi-3与2006年Tian Kegong等从江西"高热病"病死猪体内分离的毒株JXA1的各个结构蛋白阅读框的氨基酸同源性为98.0%～100%;Jiangxi-3与HB-1(sh)/2002、VR2332、RespPRRS MLV的Nsp2推导的氨基酸同源性分别为94.7%、77.8%、77.7%,由遗传系统发育树可知与2006年以前分离的毒株相比,Jiangxi-3与HB-1(sh)/2002的亲缘关系较近.说明Jiangxi-3和JXA1极可能由同一毒株HB-1(sh)/2002演化而来.
通過RT-PCR分段擴增PRRSV流行株Jiangxi-3的基因組,參照VR2332序列,根據各片段之間相重疊的區域,將擴增片段的序列依次拼接穫得Jiangxi-3完整的全基因組,併通過DNAStar軟件對其進行分析.結果錶明:Jiangxi-3的Nsp2推導氨基痠髮生30箇氨基痠的不連續缺失,與HB-1(sh)/2002相比,Nsp2推導的第480位氨基痠由D突變為E,缺失的位置為第481位氨基痠和532～560位氨基痠;Jiangxi-3與2006年Tian Kegong等從江西"高熱病"病死豬體內分離的毒株JXA1的各箇結構蛋白閱讀框的氨基痠同源性為98.0%～100%;Jiangxi-3與HB-1(sh)/2002、VR2332、RespPRRS MLV的Nsp2推導的氨基痠同源性分彆為94.7%、77.8%、77.7%,由遺傳繫統髮育樹可知與2006年以前分離的毒株相比,Jiangxi-3與HB-1(sh)/2002的親緣關繫較近.說明Jiangxi-3和JXA1極可能由同一毒株HB-1(sh)/2002縯化而來.
통과RT-PCR분단확증PRRSV류행주Jiangxi-3적기인조,삼조VR2332서렬,근거각편단지간상중첩적구역,장확증편단적서렬의차병접획득Jiangxi-3완정적전기인조,병통과DNAStar연건대기진행분석.결과표명:Jiangxi-3적Nsp2추도안기산발생30개안기산적불련속결실,여HB-1(sh)/2002상비,Nsp2추도적제480위안기산유D돌변위E,결실적위치위제481위안기산화532～560위안기산;Jiangxi-3여2006년Tian Kegong등종강서"고열병"병사저체내분리적독주JXA1적각개결구단백열독광적안기산동원성위98.0%～100%;Jiangxi-3여HB-1(sh)/2002、VR2332、RespPRRS MLV적Nsp2추도적안기산동원성분별위94.7%、77.8%、77.7%,유유전계통발육수가지여2006년이전분리적독주상비,Jiangxi-3여HB-1(sh)/2002적친연관계교근.설명Jiangxi-3화JXA1겁가능유동일독주HB-1(sh)/2002연화이래.
