中国预防兽医学报
中國預防獸醫學報
중국예방수의학보
CHINESE JOURNAL OF PREVENTIVE VETERINARY MEDICINE
2002年
2期
81-87
,共7页
刘光清%薛强%仇华吉%蔡雪晖%童光志%郭宝清
劉光清%薛彊%仇華吉%蔡雪暉%童光誌%郭寶清
류광청%설강%구화길%채설휘%동광지%곽보청
PRRSV%非结构基因%非结构蛋白编码区%序列分析
PRRSV%非結構基因%非結構蛋白編碼區%序列分析
PRRSV%비결구기인%비결구단백편마구%서렬분석
对猪繁殖与呼吸综合征病毒的非结构基因(ORFl)和非编码区分别进行了克隆和测序,并对其基因特征作了分析.结果表明,CH-la株ORFl全长11882nt,其中ORFla长7512nt、ORFlb长4374nt.它们与VR2332株的核苷酸同源性分别为89%、92%;与LV株的核苷酸同源性分别为54%、63.3%.ORFl编码两个聚合蛋白,其中ORFla编码的聚合蛋白经裂解后产生6个成熟的非结构蛋白(Nsplα、Nsplβ、Nsp2-5),以Nsp2的变异性最为显著,它与LV株的氨基酸同源性为41%.ORFlb编码的聚合蛋白经裂解后,产生4个成熟的非结构蛋白(RdRp CP24),其中RdRp为病毒的复制酶,CP4表现出较大的变异性,与LV株的氨基酸同源性为48%.在ORFla-ORFlb的衔接区有保守的庚核苷酸滑动序列和拟节结构,它们是核糖体移码翻译所必需的结构.在基因组末端存在非编码区,其中5'NCR长190nt,比LV株5'NCR短31nt,其核苷酸同源性为61%.3'NCR长151nt,比LV株3'NCR长37nt,保守性稍高,其与VR2332株和LV株的核苷酸同源性分别为95.4%和78.2%.在3'NCR末端有一个poly(A)尾巴,长20nt.在Poly(A)尾上游有保守的八核苷酸序列,是复制酶识别并结合的区域.本研究进一步证实CH-1a株在基因型上属于北美洲型.
對豬繁殖與呼吸綜閤徵病毒的非結構基因(ORFl)和非編碼區分彆進行瞭剋隆和測序,併對其基因特徵作瞭分析.結果錶明,CH-la株ORFl全長11882nt,其中ORFla長7512nt、ORFlb長4374nt.它們與VR2332株的覈苷痠同源性分彆為89%、92%;與LV株的覈苷痠同源性分彆為54%、63.3%.ORFl編碼兩箇聚閤蛋白,其中ORFla編碼的聚閤蛋白經裂解後產生6箇成熟的非結構蛋白(Nsplα、Nsplβ、Nsp2-5),以Nsp2的變異性最為顯著,它與LV株的氨基痠同源性為41%.ORFlb編碼的聚閤蛋白經裂解後,產生4箇成熟的非結構蛋白(RdRp CP24),其中RdRp為病毒的複製酶,CP4錶現齣較大的變異性,與LV株的氨基痠同源性為48%.在ORFla-ORFlb的銜接區有保守的庚覈苷痠滑動序列和擬節結構,它們是覈糖體移碼翻譯所必需的結構.在基因組末耑存在非編碼區,其中5'NCR長190nt,比LV株5'NCR短31nt,其覈苷痠同源性為61%.3'NCR長151nt,比LV株3'NCR長37nt,保守性稍高,其與VR2332株和LV株的覈苷痠同源性分彆為95.4%和78.2%.在3'NCR末耑有一箇poly(A)尾巴,長20nt.在Poly(A)尾上遊有保守的八覈苷痠序列,是複製酶識彆併結閤的區域.本研究進一步證實CH-1a株在基因型上屬于北美洲型.
대저번식여호흡종합정병독적비결구기인(ORFl)화비편마구분별진행료극륭화측서,병대기기인특정작료분석.결과표명,CH-la주ORFl전장11882nt,기중ORFla장7512nt、ORFlb장4374nt.타문여VR2332주적핵감산동원성분별위89%、92%;여LV주적핵감산동원성분별위54%、63.3%.ORFl편마량개취합단백,기중ORFla편마적취합단백경렬해후산생6개성숙적비결구단백(Nsplα、Nsplβ、Nsp2-5),이Nsp2적변이성최위현저,타여LV주적안기산동원성위41%.ORFlb편마적취합단백경렬해후,산생4개성숙적비결구단백(RdRp CP24),기중RdRp위병독적복제매,CP4표현출교대적변이성,여LV주적안기산동원성위48%.재ORFla-ORFlb적함접구유보수적경핵감산활동서렬화의절결구,타문시핵당체이마번역소필수적결구.재기인조말단존재비편마구,기중5'NCR장190nt,비LV주5'NCR단31nt,기핵감산동원성위61%.3'NCR장151nt,비LV주3'NCR장37nt,보수성초고,기여VR2332주화LV주적핵감산동원성분별위95.4%화78.2%.재3'NCR말단유일개poly(A)미파,장20nt.재Poly(A)미상유유보수적팔핵감산서렬,시복제매식별병결합적구역.본연구진일보증실CH-1a주재기인형상속우북미주형.