原子与分子物理学报
原子與分子物理學報
원자여분자물이학보
CHINESE JOURNAL OF ATOMIC AND MOLECULAR PHYSICS
2012年
3期
393-399
,共7页
程伟渊%梁志强%张庆刚%伊长虹%王伟%王克彦
程偉淵%樑誌彊%張慶剛%伊長虹%王偉%王剋彥
정위연%량지강%장경강%이장홍%왕위%왕극언
分子动力学%MM-PBSA%结合自由能%p53-MDM2相互作用%氢键动力学
分子動力學%MM-PBSA%結閤自由能%p53-MDM2相互作用%氫鍵動力學
분자동역학%MM-PBSA%결합자유능%p53-MDM2상호작용%경건동역학
p53-MDM2相互作用的抑制已经成为治疗癌症的新方法.本文特分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics/passion-Boltzman surface area)方法结合起来研究MDM2-p53相互作用机制.结果证明范德华相互作用驱动了MDM2与p53的结合.基于残基-残基相互作用的计算不仅证明p53的三个残基Phe19’,Trp23’和Leu26’与MDM2有较强的相互作用,而且还发现另外两个残基Leu22’和Pro27’也与MDM2有较强的相互作用,这为抗癌药物的设计提供了新靶标.同时也证明CH-CH,CH-π和π-π相互作用驱动了p53在MDM2疏水性裂缝中的结合.
p53-MDM2相互作用的抑製已經成為治療癌癥的新方法.本文特分子動力學模擬和MM-PBSA(molecular mechanics/passion-Boltzman surface area)方法結閤起來研究MDM2-p53相互作用機製.結果證明範德華相互作用驅動瞭MDM2與p53的結閤.基于殘基-殘基相互作用的計算不僅證明p53的三箇殘基Phe19’,Trp23’和Leu26’與MDM2有較彊的相互作用,而且還髮現另外兩箇殘基Leu22’和Pro27’也與MDM2有較彊的相互作用,這為抗癌藥物的設計提供瞭新靶標.同時也證明CH-CH,CH-π和π-π相互作用驅動瞭p53在MDM2疏水性裂縫中的結閤.
p53-MDM2상호작용적억제이경성위치료암증적신방법.본문특분자동역학모의화MM-PBSA(molecular mechanics/passion-Boltzman surface area)방법결합기래연구MDM2-p53상호작용궤제.결과증명범덕화상호작용구동료MDM2여p53적결합.기우잔기-잔기상호작용적계산불부증명p53적삼개잔기Phe19’,Trp23’화Leu26’여MDM2유교강적상호작용,이차환발현령외량개잔기Leu22’화Pro27’야여MDM2유교강적상호작용,저위항암약물적설계제공료신파표.동시야증명CH-CH,CH-π화π-π상호작용구동료p53재MDM2소수성렬봉중적결합.