高等学校化学学报
高等學校化學學報
고등학교화학학보
CHEMICAL JOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES
2011年
6期
1339-1342
,共4页
李帅%李兆龙%胡玉琳%高雪峰%黄旭日
李帥%李兆龍%鬍玉琳%高雪峰%黃旭日
리수%리조룡%호옥림%고설봉%황욱일
分子动力学%分子对接%手性%精氨酸酶
分子動力學%分子對接%手性%精氨痠酶
분자동역학%분자대접%수성%정안산매
运用分子对接和分子动力学模拟方法对精氨酸酶进行手性选择性研究.通过比较精氨酸酶Ⅰ与L,D型精氨酸复合物的结构,发现精氨酸酶Ⅰ与L型精氨酸结合得更紧密.进一步分析比较复合物分子动力学轨迹发现,精氨酸酶Ⅰ与L型精氨酸分子的复合物RMSD曲线的震荡较小,而且酶与L型底物的结合能大于酶与D型底物的结合能.在催化精氨酸脱胍基的反应中,精氨酸酶Ⅰ只选择L型精氨酸分子是基于酶的手性选择性,手性选择性是由酶的活性口袋形状决定的.
運用分子對接和分子動力學模擬方法對精氨痠酶進行手性選擇性研究.通過比較精氨痠酶Ⅰ與L,D型精氨痠複閤物的結構,髮現精氨痠酶Ⅰ與L型精氨痠結閤得更緊密.進一步分析比較複閤物分子動力學軌跡髮現,精氨痠酶Ⅰ與L型精氨痠分子的複閤物RMSD麯線的震盪較小,而且酶與L型底物的結閤能大于酶與D型底物的結閤能.在催化精氨痠脫胍基的反應中,精氨痠酶Ⅰ隻選擇L型精氨痠分子是基于酶的手性選擇性,手性選擇性是由酶的活性口袋形狀決定的.
운용분자대접화분자동역학모의방법대정안산매진행수성선택성연구.통과비교정안산매Ⅰ여L,D형정안산복합물적결구,발현정안산매Ⅰ여L형정안산결합득경긴밀.진일보분석비교복합물분자동역학궤적발현,정안산매Ⅰ여L형정안산분자적복합물RMSD곡선적진탕교소,이차매여L형저물적결합능대우매여D형저물적결합능.재최화정안산탈고기적반응중,정안산매Ⅰ지선택L형정안산분자시기우매적수성선택성,수성선택성시유매적활성구대형상결정적.
