中国肿瘤临床
中國腫瘤臨床
중국종류림상
CHINESE JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY
2011年
7期
361-366
,共6页
李余发%肖法嫚%梁莉%丁彦青%余力
李餘髮%肖法嫚%樑莉%丁彥青%餘力
리여발%초법만%량리%정언청%여력
cDNA基因%表达谱芯片%大肠癌%生物信息学%FMNL2
cDNA基因%錶達譜芯片%大腸癌%生物信息學%FMNL2
cDNA기인%표체보심편%대장암%생물신식학%FMNL2
目的:研究各转移能力不同细胞系中的基因表达差异.方法:各转移能力不同的细胞系SW480、SW620、SW480/M5标本的mRNA与表达谱芯片杂交,获得表达差异基因.用生物信息学方法对基因FMNL2进行初步分析,以及用荧光定量PCR检测了转移能力不同的细胞系SW480、SW620、SW480/M5中FMNL2的表达.结果:表达谱芯片共找出了422条差异表达基因.用生物信息学方法分析了表达上调的基因FMNL2的结构、染色体定位、编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位等信息.对FMNL2蛋白的多物种相似蛋白进行了系统进化分析,基本明确了该基因编码一种在胚胎和肿瘤细胞中高表达、进化中保守的核蛋白,以及证实了该基因在转移能力高的SW620和SW480/M5中比SW480中要高.结论:生物信息学分析表明,FMNL2是一个有研究价值的癌相关蛋白.这个蛋白可能参与正常的胚胎发育,但也与肿瘤转移能力有一定的关系.
目的:研究各轉移能力不同細胞繫中的基因錶達差異.方法:各轉移能力不同的細胞繫SW480、SW620、SW480/M5標本的mRNA與錶達譜芯片雜交,穫得錶達差異基因.用生物信息學方法對基因FMNL2進行初步分析,以及用熒光定量PCR檢測瞭轉移能力不同的細胞繫SW480、SW620、SW480/M5中FMNL2的錶達.結果:錶達譜芯片共找齣瞭422條差異錶達基因.用生物信息學方法分析瞭錶達上調的基因FMNL2的結構、染色體定位、編碼蛋白質的理化性質、亞細胞定位等信息.對FMNL2蛋白的多物種相似蛋白進行瞭繫統進化分析,基本明確瞭該基因編碼一種在胚胎和腫瘤細胞中高錶達、進化中保守的覈蛋白,以及證實瞭該基因在轉移能力高的SW620和SW480/M5中比SW480中要高.結論:生物信息學分析錶明,FMNL2是一箇有研究價值的癌相關蛋白.這箇蛋白可能參與正常的胚胎髮育,但也與腫瘤轉移能力有一定的關繫.
목적:연구각전이능력불동세포계중적기인표체차이.방법:각전이능력불동적세포계SW480、SW620、SW480/M5표본적mRNA여표체보심편잡교,획득표체차이기인.용생물신식학방법대기인FMNL2진행초보분석,이급용형광정량PCR검측료전이능력불동적세포계SW480、SW620、SW480/M5중FMNL2적표체.결과:표체보심편공조출료422조차이표체기인.용생물신식학방법분석료표체상조적기인FMNL2적결구、염색체정위、편마단백질적이화성질、아세포정위등신식.대FMNL2단백적다물충상사단백진행료계통진화분석,기본명학료해기인편마일충재배태화종류세포중고표체、진화중보수적핵단백,이급증실료해기인재전이능력고적SW620화SW480/M5중비SW480중요고.결론:생물신식학분석표명,FMNL2시일개유연구개치적암상관단백.저개단백가능삼여정상적배태발육,단야여종류전이능력유일정적관계.
