CAJ | 학술논문

目的:结合本实验室研究结果,充分利用NCBI的核酸和蛋白数据库中检索到的CagA基因碱基和蛋白质氨基酸序列,分析其序列特征以及与地域和疾病的相关性.方法:利用Vector NTI Suite 9.0,ClastalX(version 1.8),Phylip(version 3.5)和Treeview(version 1.61)软件对检索到的幽门螺杆菌CagA基因碱基和蛋白质氨基酸序列进行多序列比较和系统发育分析.结果:检索到可以利用的全序列44条,部分序列560条.通过44条全序列比对,相似性分析和构建系统进化树,发现CagA基因碱基和蛋白质氨基酸序列可分为具有明显地域特征的东西方两类.通过44条CagA全序列和266条C端部分序列分析,发现C端相对多变区的重复序列可分为两类:第一类为菌株共有的不连续重复序列,第二类为个别菌株特有的连续重复序列,此类重复序列包含EPIYA模体的重复.序列特征与疾病的关系分析表明,非胃癌株中包含第二类重复序列的菌株占13%(9/71),胃癌株中包含第二类重复序列的菌株占3l%(12/39),X2检验P=0.021＜0.05,故可以认为胃癌株中包含第二类重复序列出现率高于非胃癌株,可以认为包含第二类重复序列的菌株与胃癌有关.结论:幽门螺杆菌CagA基因及蛋白序列多态性明显,具有东西方两个地域聚类特征,重复序列可分为两类.第二类重复序列中包含EPIYA模体的重复可能导致菌株致病性增强.
목적:결합본실험실연구결과,충분이용NCBI적핵산화단백수거고중검색도적CagA기인감기화단백질안기산서렬,분석기서렬특정이급여지역화질병적상관성.방법:이용Vector NTI Suite 9.0,ClastalX(version 1.8),Phylip(version 3.5)화Treeview(version 1.61)연건대검색도적유문라간균CagA기인감기화단백질안기산서렬진행다서렬비교화계통발육분석.결과:검색도가이이용적전서렬44조,부분서렬560조.통과44조전서렬비대,상사성분석화구건계통진화수,발현CagA기인감기화단백질안기산서렬가분위구유명현지역특정적동서방량류.통과44조CagA전서렬화266조C단부분서렬분석,발현C단상대다변구적중복서렬가분위량류:제일류위균주공유적불련속중복서렬,제이류위개별균주특유적련속중복서렬,차류중복서렬포함EPIYA모체적중복.서렬특정여질병적관계분석표명,비위암주중포함제이류중복서렬적균주점13%(9/71),위암주중포함제이류중복서렬적균주점3l%(12/39),X2검험P=0.021＜0.05,고가이인위위암주중포함제이류중복서렬출현솔고우비위암주,가이인위포함제이류중복서렬적균주여위암유관.결론:유문라간균CagA기인급단백서렬다태성명현,구유동서방량개지역취류특정,중복서렬가분위량류.제이류중복서렬중포함EPIYA모체적중복가능도치균주치병성증강.