湖南师范大学自然科学学报
湖南師範大學自然科學學報
호남사범대학자연과학학보
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS NORMALIS HUNANENSIS
2008年
3期
98-101
,共4页
刘元东%刘楚干%李琳%邹俐宏%刘学端%邱冠周
劉元東%劉楚榦%李琳%鄒俐宏%劉學耑%邱冠週
류원동%류초간%리림%추리굉%류학단%구관주
固氮供硫蛋白(NifS)%氧化亚铁钩端螺旋菌%同源建模%分子动力学%分子对接%磷酸吡哆醛(PLP)%半胱氨酸
固氮供硫蛋白(NifS)%氧化亞鐵鉤耑螺鏇菌%同源建模%分子動力學%分子對接%燐痠吡哆醛(PLP)%半胱氨痠
고담공류단백(NifS)%양화아철구단라선균%동원건모%분자동역학%분자대접%린산필치철(PLP)%반광안산
氧化亚铁钩端螺旋菌的nifS基因可能在它的固氮酶成熟中发挥重要的作用.为了考察由这个基因编码的蛋白质,建立了一个关于它的可靠的完整三维分子结构.建立的结构被进一步进行绑定位点搜索,跟辅因子磷酸吡哆醛(PLP)和底物半胱氨酸进行柔性分子对接,并据此识别其关键残基.在跟半胱氨酸对接中,半胱氨酸中的氨基非常靠近His102,Lys204和PLP,半胱氨酸跟它们的相互作用能也很大,这些情况跟那些来自其他生物的固氮供硫蛋白(NifS)类似物的实验事实一致.根据这些结果,这个基因编码NifS;底物半胱氨酸能被有效地募集到激活位点.
氧化亞鐵鉤耑螺鏇菌的nifS基因可能在它的固氮酶成熟中髮揮重要的作用.為瞭攷察由這箇基因編碼的蛋白質,建立瞭一箇關于它的可靠的完整三維分子結構.建立的結構被進一步進行綁定位點搜索,跟輔因子燐痠吡哆醛(PLP)和底物半胱氨痠進行柔性分子對接,併據此識彆其關鍵殘基.在跟半胱氨痠對接中,半胱氨痠中的氨基非常靠近His102,Lys204和PLP,半胱氨痠跟它們的相互作用能也很大,這些情況跟那些來自其他生物的固氮供硫蛋白(NifS)類似物的實驗事實一緻.根據這些結果,這箇基因編碼NifS;底物半胱氨痠能被有效地募集到激活位點.
양화아철구단라선균적nifS기인가능재타적고담매성숙중발휘중요적작용.위료고찰유저개기인편마적단백질,건립료일개관우타적가고적완정삼유분자결구.건립적결구피진일보진행방정위점수색,근보인자린산필치철(PLP)화저물반광안산진행유성분자대접,병거차식별기관건잔기.재근반광안산대접중,반광안산중적안기비상고근His102,Lys204화PLP,반광안산근타문적상호작용능야흔대,저사정황근나사래자기타생물적고담공류단백(NifS)유사물적실험사실일치.근거저사결과,저개기인편마NifS;저물반광안산능피유효지모집도격활위점.
