郑州大学学报（医学版）
鄭州大學學報（醫學版）
정주대학학보（의학판）
JOURNAL OF ZHENGZHOU UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCES)
2012年
4期
545-547
,共3页
新德里金属β-酰胺酶%超级细菌%基因进化
新德裏金屬β-酰胺酶%超級細菌%基因進化
신덕리금속β-선알매%초급세균%기인진화
目的:研究新德里金属β-酰胺酶(NDM-1)基因的特征,分析其可能的来源.方法:在美国生物信息中心(NCBI)检索NDM-1基因,使用Blast生物学软件对检索到的基因与GenBank进行比对.使用ClustalW2.0生物学软件,对5条NDM-1基因和30条各亚型β-内酰胺酶基因进行多序列比较.结果:在NCBI中检索到3条NDM-1基因,与GenBank比较后共发现9条基因序列与NDM-1基因同源性较高,其中2条为两株海洋细菌的部分基因序列(同源性达69%和70%).选择5条NDM-1基因与30条β-内酰胺酶基因进行多序列比较,同源性均很低,在基因进化树上NDM-1基因与β-内酰胺酶基因位于不同分枝.结论:NDM-1基因并非来源于β-内酰胺酶基因,NDM-1基因可能与两株海洋细菌有一定的亲缘关系.
目的:研究新德裏金屬β-酰胺酶(NDM-1)基因的特徵,分析其可能的來源.方法:在美國生物信息中心(NCBI)檢索NDM-1基因,使用Blast生物學軟件對檢索到的基因與GenBank進行比對.使用ClustalW2.0生物學軟件,對5條NDM-1基因和30條各亞型β-內酰胺酶基因進行多序列比較.結果:在NCBI中檢索到3條NDM-1基因,與GenBank比較後共髮現9條基因序列與NDM-1基因同源性較高,其中2條為兩株海洋細菌的部分基因序列(同源性達69%和70%).選擇5條NDM-1基因與30條β-內酰胺酶基因進行多序列比較,同源性均很低,在基因進化樹上NDM-1基因與β-內酰胺酶基因位于不同分枝.結論:NDM-1基因併非來源于β-內酰胺酶基因,NDM-1基因可能與兩株海洋細菌有一定的親緣關繫.
목적:연구신덕리금속β-선알매(NDM-1)기인적특정,분석기가능적래원.방법:재미국생물신식중심(NCBI)검색NDM-1기인,사용Blast생물학연건대검색도적기인여GenBank진행비대.사용ClustalW2.0생물학연건,대5조NDM-1기인화30조각아형β-내선알매기인진행다서렬비교.결과:재NCBI중검색도3조NDM-1기인,여GenBank비교후공발현9조기인서렬여NDM-1기인동원성교고,기중2조위량주해양세균적부분기인서렬(동원성체69%화70%).선택5조NDM-1기인여30조β-내선알매기인진행다서렬비교,동원성균흔저,재기인진화수상NDM-1기인여β-내선알매기인위우불동분지.결론:NDM-1기인병비래원우β-내선알매기인,NDM-1기인가능여량주해양세균유일정적친연관계.
