生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2011年
1期
60-64
,共5页
生物信息学%纤连蛋白结合蛋白%链球菌属
生物信息學%纖連蛋白結閤蛋白%鏈毬菌屬
생물신식학%섬련단백결합단백%련구균속
对链球菌属纤连蛋白结合蛋白进行系统的分析,找出其特征,为以后的研究奠定基础.通过MUSCLE、BLASTP、PSI-BLAST、PHYLIP、Perl编程等生物信息学方法对217条候选纤连蛋白结合蛋白进行研究.发现共有31个序列纤连蛋白结合蛋白重复单元序列模体,绝大部分蛋白由两个或两个以上的不同模体序列构成,其保守结构域组合呈现多样性等特征.表明链球菌属纤连蛋白结合蛋白重复单元序列模体不是严格统一的,总体上具有变异性,但模体之间又有很大的相似性.
對鏈毬菌屬纖連蛋白結閤蛋白進行繫統的分析,找齣其特徵,為以後的研究奠定基礎.通過MUSCLE、BLASTP、PSI-BLAST、PHYLIP、Perl編程等生物信息學方法對217條候選纖連蛋白結閤蛋白進行研究.髮現共有31箇序列纖連蛋白結閤蛋白重複單元序列模體,絕大部分蛋白由兩箇或兩箇以上的不同模體序列構成,其保守結構域組閤呈現多樣性等特徵.錶明鏈毬菌屬纖連蛋白結閤蛋白重複單元序列模體不是嚴格統一的,總體上具有變異性,但模體之間又有很大的相似性.
대련구균속섬련단백결합단백진행계통적분석,조출기특정,위이후적연구전정기출.통과MUSCLE、BLASTP、PSI-BLAST、PHYLIP、Perl편정등생물신식학방법대217조후선섬련단백결합단백진행연구.발현공유31개서렬섬련단백결합단백중복단원서렬모체,절대부분단백유량개혹량개이상적불동모체서렬구성,기보수결구역조합정현다양성등특정.표명련구균속섬련단백결합단백중복단원서렬모체불시엄격통일적,총체상구유변이성,단모체지간우유흔대적상사성.
