华南理工大学学报（自然科学版）
華南理工大學學報（自然科學版）
화남리공대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SOUTH CHINA UNIVERSITY OF TECHNOLOGY(NATURAL SCIENCE EDITION)
2012年
8期
106-109
,共4页
刘雪梅%文德华%於黄忠%高亚妮
劉雪梅%文德華%於黃忠%高亞妮
류설매%문덕화%어황충%고아니
非序列比对%D2shepp统计法%局部比对%Power值
非序列比對%D2shepp統計法%跼部比對%Power值
비서렬비대%D2shepp통계법%국부비대%Power치
两条生物序列间的相似性比对是计算生物学探讨的主要问题之一,一种快速的依赖于k-元组的D2shepp统计法目前已被应用到非序列比对中.文中在零模型的基础上产生两条相互独立的随机序列,基于D2shepp统计法进行了两条序列的局部比对,找到局部比对的最优值并求和.在此基础上模拟了Power值的分布情况,并分析了不同k参数下的Power值分布.在相同参数下将文中提出的局部比对与已有的D2shepp统计的全局比对进行比较,发现局部比对D2shepp统计的Power值随着序列长度的增大而快速地接近于1,比全局比对更加快速、准确.
兩條生物序列間的相似性比對是計算生物學探討的主要問題之一,一種快速的依賴于k-元組的D2shepp統計法目前已被應用到非序列比對中.文中在零模型的基礎上產生兩條相互獨立的隨機序列,基于D2shepp統計法進行瞭兩條序列的跼部比對,找到跼部比對的最優值併求和.在此基礎上模擬瞭Power值的分佈情況,併分析瞭不同k參數下的Power值分佈.在相同參數下將文中提齣的跼部比對與已有的D2shepp統計的全跼比對進行比較,髮現跼部比對D2shepp統計的Power值隨著序列長度的增大而快速地接近于1,比全跼比對更加快速、準確.
량조생물서렬간적상사성비대시계산생물학탐토적주요문제지일,일충쾌속적의뢰우k-원조적D2shepp통계법목전이피응용도비서렬비대중.문중재령모형적기출상산생량조상호독립적수궤서렬,기우D2shepp통계법진행료량조서렬적국부비대,조도국부비대적최우치병구화.재차기출상모의료Power치적분포정황,병분석료불동k삼수하적Power치분포.재상동삼수하장문중제출적국부비대여이유적D2shepp통계적전국비대진행비교,발현국부비대D2shepp통계적Power치수착서렬장도적증대이쾌속지접근우1,비전국비대경가쾌속、준학.
