基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2010年
5期
897-903
,共7页
黑蕾%王玉婧%陈浩%赵宇玮%郝建国%贾敬芬
黑蕾%王玉婧%陳浩%趙宇瑋%郝建國%賈敬芬
흑뢰%왕옥청%진호%조우위%학건국%가경분
青稞%胆碱单加氧酶%基因克隆%RT-PCR%序列分析
青稞%膽堿單加氧酶%基因剋隆%RT-PCR%序列分析
청과%담감단가양매%기인극륭%RT-PCR%서렬분석
甜菜碱是一种存在于多种生物体内的季胺类高效渗透调节剂,是由甜菜碱合成酶系催化的.为了研究甜菜碱合成酶系基因的表达和青稞高抗逆性之间的关系,我们以经200 mmol/L NaCl预处理72 h的青稞幼苗叶片及根中提取的总RNA为模板,采用RT-PCR技术,扩增得到全长1 224 bp,推测编码407个氨基酸残基的青稞胆碱单加氧酶(choline monooxygenase,cmo)基因cDNA全长开放阅读框(open reading frame,ORE),将其命名为hvcmol并在GenBank中注册,获得登录号为GU810840.生物信息学分析表明,推定的氨基酸序列中含有与已报道高等植物胆碱单加氧酶氨基酸序列中的Rieske型铁硫簇结合区和单核铁结合基序等特征性结构域具有高度保守性的特征性结构域.与多种高等植物cmo基因进行序列同源性比对分析结果显示:hvcmol的核苷酸序列与甜菜、盐角草、菠菜、辽宁碱蓬、拟南芥、玉米、水稻、高粱、羊草和大麦等植物的cmo mRNA编码区相似性分别为55.3%、55.4%、55.6%、5.9%、61.3%、82.6%、83.3%、83.4%、95.5%和99.5%.实验过程中,我们发现,青稞hvcmol基因的表达必须被一定浓度的NaC;l诱导,说明hvcmol可能在调节环境胁迫下青稞细胞内甘氨酸甜菜碱合成方面起着关键的作用,同时它可以作为研究环境胁迫下甘氨酸甜菜碱合成调节的模型.本结果为研究青稞甘氨酸甜菜碱合成酶系基因的诱导表达及其与青稞强抗逆性之间的关系奠定了基础.
甜菜堿是一種存在于多種生物體內的季胺類高效滲透調節劑,是由甜菜堿閤成酶繫催化的.為瞭研究甜菜堿閤成酶繫基因的錶達和青稞高抗逆性之間的關繫,我們以經200 mmol/L NaCl預處理72 h的青稞幼苗葉片及根中提取的總RNA為模闆,採用RT-PCR技術,擴增得到全長1 224 bp,推測編碼407箇氨基痠殘基的青稞膽堿單加氧酶(choline monooxygenase,cmo)基因cDNA全長開放閱讀框(open reading frame,ORE),將其命名為hvcmol併在GenBank中註冊,穫得登錄號為GU810840.生物信息學分析錶明,推定的氨基痠序列中含有與已報道高等植物膽堿單加氧酶氨基痠序列中的Rieske型鐵硫簇結閤區和單覈鐵結閤基序等特徵性結構域具有高度保守性的特徵性結構域.與多種高等植物cmo基因進行序列同源性比對分析結果顯示:hvcmol的覈苷痠序列與甜菜、鹽角草、菠菜、遼寧堿蓬、擬南芥、玉米、水稻、高粱、羊草和大麥等植物的cmo mRNA編碼區相似性分彆為55.3%、55.4%、55.6%、5.9%、61.3%、82.6%、83.3%、83.4%、95.5%和99.5%.實驗過程中,我們髮現,青稞hvcmol基因的錶達必鬚被一定濃度的NaC;l誘導,說明hvcmol可能在調節環境脅迫下青稞細胞內甘氨痠甜菜堿閤成方麵起著關鍵的作用,同時它可以作為研究環境脅迫下甘氨痠甜菜堿閤成調節的模型.本結果為研究青稞甘氨痠甜菜堿閤成酶繫基因的誘導錶達及其與青稞彊抗逆性之間的關繫奠定瞭基礎.
첨채감시일충존재우다충생물체내적계알류고효삼투조절제,시유첨채감합성매계최화적.위료연구첨채감합성매계기인적표체화청과고항역성지간적관계,아문이경200 mmol/L NaCl예처리72 h적청과유묘협편급근중제취적총RNA위모판,채용RT-PCR기술,확증득도전장1 224 bp,추측편마407개안기산잔기적청과담감단가양매(choline monooxygenase,cmo)기인cDNA전장개방열독광(open reading frame,ORE),장기명명위hvcmol병재GenBank중주책,획득등록호위GU810840.생물신식학분석표명,추정적안기산서렬중함유여이보도고등식물담감단가양매안기산서렬중적Rieske형철류족결합구화단핵철결합기서등특정성결구역구유고도보수성적특정성결구역.여다충고등식물cmo기인진행서렬동원성비대분석결과현시:hvcmol적핵감산서렬여첨채、염각초、파채、료녕감봉、의남개、옥미、수도、고량、양초화대맥등식물적cmo mRNA편마구상사성분별위55.3%、55.4%、55.6%、5.9%、61.3%、82.6%、83.3%、83.4%、95.5%화99.5%.실험과정중,아문발현,청과hvcmol기인적표체필수피일정농도적NaC;l유도,설명hvcmol가능재조절배경협박하청과세포내감안산첨채감합성방면기착관건적작용,동시타가이작위연구배경협박하감안산첨채감합성조절적모형.본결과위연구청과감안산첨채감합성매계기인적유도표체급기여청과강항역성지간적관계전정료기출.