中国分子心脏病学杂志
中國分子心髒病學雜誌
중국분자심장병학잡지
MOLECULAR CARDIOLOGY OF CHINA
2007年
3期
129-134
,共6页
杜胜军%甄一松%周春晓%惠汝太
杜勝軍%甄一鬆%週春曉%惠汝太
두성군%견일송%주춘효%혜여태
顺式调控模块%背景序列集%GC含量%位置权重矩阵%受试者工作曲线
順式調控模塊%揹景序列集%GC含量%位置權重矩陣%受試者工作麯線
순식조공모괴%배경서렬집%GC함량%위치권중구진%수시자공작곡선
在人类基因组上正确识别转录调控信号仍然是分子生物学界面临的重要挑战,目前计算的手段仍然是寻找转录调控元件的主要方法.然而这些方法普遍存在假阳性率过高的问题,而降低假阳性率的方法之一就是参数的优化选择.这些预测算法都普遍需要一个背景序列集作为训练集合中的阴性集合,我们假设背景序列集合的选择对预测算法的预测能力会产生重要影响,然而目前很少有人研究背景序列的选择问题.本文就组织特异的转录调控元件预测模型的背景序列集的选择问题进行了探讨.我们的研究结果表明,根据该组织特异的转录因子结合位点序列的GC含量选择的背景序列集,可以改进预测模型的预测能力.
在人類基因組上正確識彆轉錄調控信號仍然是分子生物學界麵臨的重要挑戰,目前計算的手段仍然是尋找轉錄調控元件的主要方法.然而這些方法普遍存在假暘性率過高的問題,而降低假暘性率的方法之一就是參數的優化選擇.這些預測算法都普遍需要一箇揹景序列集作為訓練集閤中的陰性集閤,我們假設揹景序列集閤的選擇對預測算法的預測能力會產生重要影響,然而目前很少有人研究揹景序列的選擇問題.本文就組織特異的轉錄調控元件預測模型的揹景序列集的選擇問題進行瞭探討.我們的研究結果錶明,根據該組織特異的轉錄因子結閤位點序列的GC含量選擇的揹景序列集,可以改進預測模型的預測能力.
재인류기인조상정학식별전록조공신호잉연시분자생물학계면림적중요도전,목전계산적수단잉연시심조전록조공원건적주요방법.연이저사방법보편존재가양성솔과고적문제,이강저가양성솔적방법지일취시삼수적우화선택.저사예측산법도보편수요일개배경서렬집작위훈련집합중적음성집합,아문가설배경서렬집합적선택대예측산법적예측능력회산생중요영향,연이목전흔소유인연구배경서렬적선택문제.본문취조직특이적전록조공원건예측모형적배경서렬집적선택문제진행료탐토.아문적연구결과표명,근거해조직특이적전록인자결합위점서렬적GC함량선택적배경서렬집,가이개진예측모형적예측능력.
