中国生物化学与分子生物学报
中國生物化學與分子生物學報
중국생물화학여분자생물학보
CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY
2001年
6期
766-771
,共6页
侯化%杨光彩%王曙%黄扬中%刘德忠
侯化%楊光綵%王曙%黃颺中%劉德忠
후화%양광채%왕서%황양중%류덕충
核酶,计算机设计,HPV11 E2
覈酶,計算機設計,HPV11 E2
핵매,계산궤설계,HPV11 E2
借助计算机软件分析,设计出能特异性切割HPV11型644 nt E2 mRNA的核酶(ribozyme).遵循Symon＇s锤头状核酶结构和GUX剪切位点原则,靶序列存在32个这样的剪切位点.通过计算机软件分析出核酶的最佳剪切位点,并对底物及核酶的二级结构进行预测及进行相应基因生物学功能和基因同源性分析,筛选出2个锤头结构核酶.针对这两位点设计的核酶分别命名为RZ2777和RZ3281.计算机分析显示,两核酶与底物切点两翼碱基形成锤头状结构,切点所在基因序列具有相对松弛的二级结构,位于该基因重要生物功能区内,是核酶的理想攻击区域.通过基因库检索,在已知人类基因排除了与上述两核酶切点两翼碱基有基因同源性序列的可能性.将两核酶用于体外剪切实验取得了良好的实验结果,认为借助计算机分析可帮助尽快从多个剪切位点选择出最适核酶.
藉助計算機軟件分析,設計齣能特異性切割HPV11型644 nt E2 mRNA的覈酶(ribozyme).遵循Symon＇s錘頭狀覈酶結構和GUX剪切位點原則,靶序列存在32箇這樣的剪切位點.通過計算機軟件分析齣覈酶的最佳剪切位點,併對底物及覈酶的二級結構進行預測及進行相應基因生物學功能和基因同源性分析,篩選齣2箇錘頭結構覈酶.針對這兩位點設計的覈酶分彆命名為RZ2777和RZ3281.計算機分析顯示,兩覈酶與底物切點兩翼堿基形成錘頭狀結構,切點所在基因序列具有相對鬆弛的二級結構,位于該基因重要生物功能區內,是覈酶的理想攻擊區域.通過基因庫檢索,在已知人類基因排除瞭與上述兩覈酶切點兩翼堿基有基因同源性序列的可能性.將兩覈酶用于體外剪切實驗取得瞭良好的實驗結果,認為藉助計算機分析可幫助儘快從多箇剪切位點選擇齣最適覈酶.
차조계산궤연건분석,설계출능특이성절할HPV11형644 nt E2 mRNA적핵매(ribozyme).준순Symon＇s추두상핵매결구화GUX전절위점원칙,파서렬존재32개저양적전절위점.통과계산궤연건분석출핵매적최가전절위점,병대저물급핵매적이급결구진행예측급진행상응기인생물학공능화기인동원성분석,사선출2개추두결구핵매.침대저량위점설계적핵매분별명명위RZ2777화RZ3281.계산궤분석현시,량핵매여저물절점량익감기형성추두상결구,절점소재기인서렬구유상대송이적이급결구,위우해기인중요생물공능구내,시핵매적이상공격구역.통과기인고검색,재이지인류기인배제료여상술량핵매절점량익감기유기인동원성서렬적가능성.장량핵매용우체외전절실험취득료량호적실험결과,인위차조계산궤분석가방조진쾌종다개전절위점선택출최괄핵매.
