中国病毒学
中國病毒學
중국병독학
VIROLOGICA SINICA
2001年
2期
140-145
,共6页
孙成群%陈露菲%刘彦成%崔岩%吴玉华%许君%李冀宏%刘忠伟%孙蓉芳%甄尚敏%张秀彬%张宝山%孔宪刚
孫成群%陳露菲%劉彥成%崔巖%吳玉華%許君%李冀宏%劉忠偉%孫蓉芳%甄尚敏%張秀彬%張寶山%孔憲剛
손성군%진로비%류언성%최암%오옥화%허군%리기굉%류충위%손용방%견상민%장수빈%장보산%공헌강
汉坦病毒%分子克隆%聚合酶链反应%碱基序列
漢坦病毒%分子剋隆%聚閤酶鏈反應%堿基序列
한탄병독%분자극륭%취합매련반응%감기서렬
黑龙江省是肾综合征出血热(HFRS)的重疫区。近年来HFRS年的发病人数曾超过万人。流行病学和血清学研究表明黑龙江省HFRS疫区主要是姬鼠型，但目前尚缺乏病毒的分子生物学资料。我们对从疫区捕获的宿主动物-黑线姬鼠肺中分离的汉坦病毒HTN261株的S基因片段的全基因序列进行了测定和初步分析。结果如下，HTN261株的S基因片段的全序列长为1697nt。只有一个主要的编码N蛋白的ORF，起始位置为第37nt，终止于1326nt，编码的蛋白长为429aa。没有发现存在ORF2。HTN261株的S基因片段核苷酸序列与HTN型中的病毒株的同源性很高，而与汉坦病毒其他型的同源性较差。从种系发生树分析来看，HTN261株归结于汉坦病毒的HTN型。在HTN型之内，HTN261株和HTN76-118株在一个分枝内。就其核苷酸和蛋白的同源性来说，HTN261株和HTN76-118株的同源性分别是89%(全S基因)和98%(蛋白)。而与中国境内发现的其他汉坦病毒株Z10，HU，Chen4，NC167等基因和蛋白的同源性相对较差。汉坦病毒除具有其宿主的依赖性外，还具有其地理的簇集性。HTN261株和HTN76-118株之间S基因和N蛋白序列的变异性的差异分别为11%和2%，表明HTN261株和HTN76-118株还有不同，可能是不同的亚型。不过，尚有待于进一步研究证明。
黑龍江省是腎綜閤徵齣血熱(HFRS)的重疫區。近年來HFRS年的髮病人數曾超過萬人。流行病學和血清學研究錶明黑龍江省HFRS疫區主要是姬鼠型，但目前尚缺乏病毒的分子生物學資料。我們對從疫區捕穫的宿主動物-黑線姬鼠肺中分離的漢坦病毒HTN261株的S基因片段的全基因序列進行瞭測定和初步分析。結果如下，HTN261株的S基因片段的全序列長為1697nt。隻有一箇主要的編碼N蛋白的ORF，起始位置為第37nt，終止于1326nt，編碼的蛋白長為429aa。沒有髮現存在ORF2。HTN261株的S基因片段覈苷痠序列與HTN型中的病毒株的同源性很高，而與漢坦病毒其他型的同源性較差。從種繫髮生樹分析來看，HTN261株歸結于漢坦病毒的HTN型。在HTN型之內，HTN261株和HTN76-118株在一箇分枝內。就其覈苷痠和蛋白的同源性來說，HTN261株和HTN76-118株的同源性分彆是89%(全S基因)和98%(蛋白)。而與中國境內髮現的其他漢坦病毒株Z10，HU，Chen4，NC167等基因和蛋白的同源性相對較差。漢坦病毒除具有其宿主的依賴性外，還具有其地理的簇集性。HTN261株和HTN76-118株之間S基因和N蛋白序列的變異性的差異分彆為11%和2%，錶明HTN261株和HTN76-118株還有不同，可能是不同的亞型。不過，尚有待于進一步研究證明。
흑룡강성시신종합정출혈열(HFRS)적중역구。근년래HFRS년적발병인수증초과만인。류행병학화혈청학연구표명흑룡강성HFRS역구주요시희서형，단목전상결핍병독적분자생물학자료。아문대종역구포획적숙주동물-흑선희서폐중분리적한탄병독HTN261주적S기인편단적전기인서렬진행료측정화초보분석。결과여하，HTN261주적S기인편단적전서렬장위1697nt。지유일개주요적편마N단백적ORF，기시위치위제37nt，종지우1326nt，편마적단백장위429aa。몰유발현존재ORF2。HTN261주적S기인편단핵감산서렬여HTN형중적병독주적동원성흔고，이여한탄병독기타형적동원성교차。종충계발생수분석래간，HTN261주귀결우한탄병독적HTN형。재HTN형지내，HTN261주화HTN76-118주재일개분지내。취기핵감산화단백적동원성래설，HTN261주화HTN76-118주적동원성분별시89%(전S기인)화98%(단백)。이여중국경내발현적기타한탄병독주Z10，HU，Chen4，NC167등기인화단백적동원성상대교차。한탄병독제구유기숙주적의뢰성외，환구유기지리적족집성。HTN261주화HTN76-118주지간S기인화N단백서렬적변이성적차이분별위11%화2%，표명HTN261주화HTN76-118주환유불동，가능시불동적아형。불과，상유대우진일보연구증명。
To determine the complete nucleotide sequence of the S genome segment of HTN261 virus strain which was isolated from the striped field mouse (Apodemus agraius) in Heilongjiang province of the Northeast China, the complete nucleotide sequence of the S genome segment of HTN261 virus strain was determined with two clones, which were obtained using RT-PCR, and by linking two overlapping fragments into PUC19 vector respectively. The complete nucleotide sequence of the S genome segment of HTN261 virus strain was 1697 nucleotides in length and contained one ORF encoding the N protein starts at position 37 and ends at position 1326. The length of predicted protein, 429 amino acids, is identical to the N protein of HTN, DOB, SEO types of hantaviruses. Comparison of S segment sequence of HTN261 strain with the corresponding sequences of other hantaviruses showed that the identities of HTN261 strain with HTN76-118 strain were 89% (complete nucleotide sequence) andd 98% (amino acid sequence). Phylogenetic analysis showed that HTN261 strain with HTN76-118 strain form one lineage within the clade containing hantaviruses of HTN type. But the identities of HTN261 strain with HTN76-118 strain differ by 11% in complete nucleotide sequence of S segment and 2% in amino acid sequence of N protein. HTN261 strain belongs to hantavirus HTN type and may be a new subtype.
