CAJ | 학술논문

对NCBI GenBank中登录的鸭肝炎病毒1型(DHV-1)全基因组及VP1基因进行生物信息学分析,27株DHV-1全基因组序列其核苷酸同源性分别为93.3%～99.8%、多聚蛋白氨基酸序列同源性则达97%～99.8%,DHV-1和其他小RNA科病毒的多聚蛋白的氨基酸序列同源性均低于30%,多聚蛋白氨基酸序列进化分析显示DHV-1在小RNA科病毒上形成一个独立的进化分支.因此,应在小RNA病毒科中设立一个DHV-1的新病毒属.分析发现,在DHV-1 VP1区存在多个免疫优势辅助性T淋巴细胞抗原位点及其抗原决定簇.在DHV-1多聚蛋白的第1 757 aa～1 761 aa位,出现3 C蛋白酶(3 Cpro)的共有基序Gly-Ser-Cys-Gly-Gly,同时发现在751 aa/752 aa处存在自我切割基序NPG ↓ P.推测在整个DHV-1多聚蛋白的切割过程中首先进行NPG ↓ P切割,形成P1,P2-P3前体蛋白,进而再由3 Cpro对2个前体蛋白进行二级加工,最终DHV-1多聚蛋白总共被切割成12个成熟产物,形成其结构蛋白与非结构蛋白.
대NCBI GenBank중등록적압간염병독1형(DHV-1)전기인조급VP1기인진행생물신식학분석,27주DHV-1전기인조서렬기핵감산동원성분별위93.3%～99.8%、다취단백안기산서렬동원성칙체97%～99.8%,DHV-1화기타소RNA과병독적다취단백적안기산서렬동원성균저우30%,다취단백안기산서렬진화분석현시DHV-1재소RNA과병독상형성일개독립적진화분지.인차,응재소RNA병독과중설립일개DHV-1적신병독속.분석발현,재DHV-1 VP1구존재다개면역우세보조성T림파세포항원위점급기항원결정족.재DHV-1다취단백적제1 757 aa～1 761 aa위,출현3 C단백매(3 Cpro)적공유기서Gly-Ser-Cys-Gly-Gly,동시발현재751 aa/752 aa처존재자아절할기서NPG ↓ P.추측재정개DHV-1다취단백적절할과정중수선진행NPG ↓ P절할,형성P1,P2-P3전체단백,진이재유3 Cpro대2개전체단백진행이급가공,최종DHV-1다취단백총공피절할성12개성숙산물,형성기결구단백여비결구단백.