中华预防医学杂志
中華預防醫學雜誌
중화예방의학잡지
CHINESE JOURNAL OF
2010年
1期
65-69
,共5页
刘斌%江朝强%Graham Neil Thomas%劳向前%林洁明%岳晓军%张维森%朱彤%林大庆
劉斌%江朝彊%Graham Neil Thomas%勞嚮前%林潔明%嶽曉軍%張維森%硃彤%林大慶
류빈%강조강%Graham Neil Thomas%로향전%림길명%악효군%장유삼%주동%림대경
心血管疾病%基因%多态性%单核甘酸%生物标本库
心血管疾病%基因%多態性%單覈甘痠%生物標本庫
심혈관질병%기인%다태성%단핵감산%생물표본고
Cardiovascular diseases%Genes%Polymorphism%single nucleotide%Biological specimen banks
目的 应用Taqman单核苷酸多态性(SNP)分型法检测广州生物库队列人群心脑血管疾病相关基因的多态性.方法 从广州生物库队列研究(GBCS)中选取2000名研究对象,应用ABI7900HT型荧光定最PCR仪并采用Taqman SNP分型法检测该人群rs4220、rs5368及rs285等15个心脑血管疾病相关基因多态性.对检测的基因分型数据采用遗传平衡定律检测,并与国际染色体单倍型计划(HapMap)的中国人群数据进行比较.结果 (1)所有15个SNP的分型数据均满足遗传平衡定律;(2)有两个SNP的分型数据与HapMap的中国人群数据差异有统计学意义(rs4220 28.2%对17.8%,X~2=4.891,P=0.028;rs5368 22.1%对32.2%,X~2=5.137,P=0.024).对比美国Perlegen公司人类遗传变异研究(AFD-CHN-PANEL)、美国科学基金会等位基因频率数据库(ALFRED)、日本生物信息学协会(JBIC-allele)等多个基因库数据,造成本研究SNP频率不同于HapMup的中国人群数据的原因是华南人群在遗传背景上与北方人群有一定的差异.结论本研究的数据可能更能反映南方人的特性,因此,建立大样本的广州人群心脑血管疾病相关基因多态性数据库以研究基因与环境对心脑血管疾病的影响是必要的.
目的 應用Taqman單覈苷痠多態性(SNP)分型法檢測廣州生物庫隊列人群心腦血管疾病相關基因的多態性.方法 從廣州生物庫隊列研究(GBCS)中選取2000名研究對象,應用ABI7900HT型熒光定最PCR儀併採用Taqman SNP分型法檢測該人群rs4220、rs5368及rs285等15箇心腦血管疾病相關基因多態性.對檢測的基因分型數據採用遺傳平衡定律檢測,併與國際染色體單倍型計劃(HapMap)的中國人群數據進行比較.結果 (1)所有15箇SNP的分型數據均滿足遺傳平衡定律;(2)有兩箇SNP的分型數據與HapMap的中國人群數據差異有統計學意義(rs4220 28.2%對17.8%,X~2=4.891,P=0.028;rs5368 22.1%對32.2%,X~2=5.137,P=0.024).對比美國Perlegen公司人類遺傳變異研究(AFD-CHN-PANEL)、美國科學基金會等位基因頻率數據庫(ALFRED)、日本生物信息學協會(JBIC-allele)等多箇基因庫數據,造成本研究SNP頻率不同于HapMup的中國人群數據的原因是華南人群在遺傳揹景上與北方人群有一定的差異.結論本研究的數據可能更能反映南方人的特性,因此,建立大樣本的廣州人群心腦血管疾病相關基因多態性數據庫以研究基因與環境對心腦血管疾病的影響是必要的.
목적 응용Taqman단핵감산다태성(SNP)분형법검측엄주생물고대렬인군심뇌혈관질병상관기인적다태성.방법 종엄주생물고대렬연구(GBCS)중선취2000명연구대상,응용ABI7900HT형형광정최PCR의병채용Taqman SNP분형법검측해인군rs4220、rs5368급rs285등15개심뇌혈관질병상관기인다태성.대검측적기인분형수거채용유전평형정률검측,병여국제염색체단배형계화(HapMap)적중국인군수거진행비교.결과 (1)소유15개SNP적분형수거균만족유전평형정률;(2)유량개SNP적분형수거여HapMap적중국인군수거차이유통계학의의(rs4220 28.2%대17.8%,X~2=4.891,P=0.028;rs5368 22.1%대32.2%,X~2=5.137,P=0.024).대비미국Perlegen공사인류유전변이연구(AFD-CHN-PANEL)、미국과학기금회등위기인빈솔수거고(ALFRED)、일본생물신식학협회(JBIC-allele)등다개기인고수거,조성본연구SNP빈솔불동우HapMup적중국인군수거적원인시화남인군재유전배경상여북방인군유일정적차이.결론본연구적수거가능경능반영남방인적특성,인차,건립대양본적엄주인군심뇌혈관질병상관기인다태성수거고이연구기인여배경대심뇌혈관질병적영향시필요적.
Objective To study the polymorphisms of cerebrovascular and cardiovascular disease genes using Taqman single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping kits. MethodsA total of 2000 subjects were recruited from the Guangzhou Biobank Cohort Study (GBCS), and 15 SNPs were detected using Taqman SNP genotyping kits and an ABI 7900HT real time PCR system. The data were tested for the Hardy-Weinberg equilibrium, and then compared with the data of the Chinese population from the International HapMap Project (HapMap_HCN). Results( 1 ) All genotypo data of the 15 SNPs were consistent with the Hardy-Weinberg rules. (2) The significant differences were observed among two SNPs,rs4220 and rs5368 and the HapMap_HCN ( rs4220 28.2% vs 17. 8% ; χ~2 = 4. 891, P = 0. 028 ; rs5368 22. 1% vs 32. 2% ,χ~2=5. 137,P =0. 024). Comparing other gene bank data,such as AFD-CHN-PANEL,the Allele Frequency Database (ALFRED)and JBIC-allele, it would be most likely that our observations represent differences between the Northern and Southern populations in China. Conclusion Such Biobank study provided a useful platform for the study of the role of genetic and environmental determinants on cerebrovascular and cardiovascular disease.
