浙江大学学报(医学版)
浙江大學學報(醫學版)
절강대학학보(의학판)
JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCES)
2003年
5期
407-411
,共5页
孙洁%黄河%宋怀东%吴昕彦
孫潔%黃河%宋懷東%吳昕彥
손길%황하%송부동%오흔언
端粒重复序列结合因子%外显子%假基因
耑粒重複序列結閤因子%外顯子%假基因
단립중복서렬결합인자%외현자%가기인
目的:确定人端粒重复序列结合因子(TERF1)的基因组结构和假基因的定位与结构.方法:利用GenBank等生物信息学资源,NCBI提供的BLAST及其他相关的生物信息学工具(Sequencher,DNA Strider和Autoassembler等),确定TERF1基因组和假基因的定位与结构,并用PCR和测序证实.结果:定位在8q13上的TERF1基因组由10个外显子构成.它有4个假基因分别分布在第13、18、21和X染色体上(ΨTERF1-13、ΨTERF1-18、ΨTERF1-21和ΨTERF1-X),其结构均与TERF1 mRNA相似,但缺少部分外显子.ΨTERF1-13、ΨTERF1-18和ΨTERF1-21的周边序列之间存在长度至少60 kb的同源片段.结论:TERF1基因组含10个外显子,它有4个加工过的假基因分布在第13、18、21和X染色体上.大片段同源序列属近期重复片段中的染色体间倍增.
目的:確定人耑粒重複序列結閤因子(TERF1)的基因組結構和假基因的定位與結構.方法:利用GenBank等生物信息學資源,NCBI提供的BLAST及其他相關的生物信息學工具(Sequencher,DNA Strider和Autoassembler等),確定TERF1基因組和假基因的定位與結構,併用PCR和測序證實.結果:定位在8q13上的TERF1基因組由10箇外顯子構成.它有4箇假基因分彆分佈在第13、18、21和X染色體上(ΨTERF1-13、ΨTERF1-18、ΨTERF1-21和ΨTERF1-X),其結構均與TERF1 mRNA相似,但缺少部分外顯子.ΨTERF1-13、ΨTERF1-18和ΨTERF1-21的週邊序列之間存在長度至少60 kb的同源片段.結論:TERF1基因組含10箇外顯子,它有4箇加工過的假基因分佈在第13、18、21和X染色體上.大片段同源序列屬近期重複片段中的染色體間倍增.
목적:학정인단립중복서렬결합인자(TERF1)적기인조결구화가기인적정위여결구.방법:이용GenBank등생물신식학자원,NCBI제공적BLAST급기타상관적생물신식학공구(Sequencher,DNA Strider화Autoassembler등),학정TERF1기인조화가기인적정위여결구,병용PCR화측서증실.결과:정위재8q13상적TERF1기인조유10개외현자구성.타유4개가기인분별분포재제13、18、21화X염색체상(ΨTERF1-13、ΨTERF1-18、ΨTERF1-21화ΨTERF1-X),기결구균여TERF1 mRNA상사,단결소부분외현자.ΨTERF1-13、ΨTERF1-18화ΨTERF1-21적주변서렬지간존재장도지소60 kb적동원편단.결론:TERF1기인조함10개외현자,타유4개가공과적가기인분포재제13、18、21화X염색체상.대편단동원서렬속근기중복편단중적염색체간배증.
