中华实验和临床病毒学杂志
中華實驗和臨床病毒學雜誌
중화실험화림상병독학잡지
CHINESE JOURNAL OF EXPERIMENTAL AND CLINICAL VIROLOGY
2003年
1期
10-14
,共5页
王大燕%王健伟%徐倏燊%温乐英%毛宇荣%于修平%洪涛
王大燕%王健偉%徐倏燊%溫樂英%毛宇榮%于脩平%洪濤
왕대연%왕건위%서숙신%온악영%모우영%우수평%홍도
轮状病毒属%蛋白质构象%基因转变
輪狀病毒屬%蛋白質構象%基因轉變
륜상병독속%단백질구상%기인전변
目的研究我国轮状病毒流行株NSP4基因的变异特点.方法对近年来从我国不同地区获得的27份人轮状病毒流行株的NSP4基因用RT-PCR进行扩增,克隆后进行全长cDNA序列分析,并利用Clustal×1.8,TreeView32及DNAStar软件与参比株Wa、KUN、AU-1、EW及来自GenBank的OSU、SA11、Hochi、US244、Bristol株的NSP4序列进行分析比较.采用PCR分型方法对VP7血清型进行鉴定,确定轮状病毒G型与NSP4基因型的关系.结果氨基酸同源性比较表明,我国轮状病毒不同流行株NSP4之间同源性为81.7%～99.4%,据此可将27株RV NSP4分为2组,分别以Wa株和KUN株为代表,其中以Wa组为主.组内同源性分别为92.0%～99.4%和92.0%～98.9%,组内变异率分别为0～8.5%及1.2%～8.5%.两组间变异率达16.6%～21.0%.氨基酸进化树提示在Wa组内包括3个亚组.轮状病毒G血清型与NSP4基因型之间的联系不确定.结论我国流行株NSP4基因主要可分为Wa组和KUN组,在Wa组内可形成三个亚组,并且在高变区有特征性的氨基酸位点.NSP4的变异与年份有关而与地域关系不密切.
目的研究我國輪狀病毒流行株NSP4基因的變異特點.方法對近年來從我國不同地區穫得的27份人輪狀病毒流行株的NSP4基因用RT-PCR進行擴增,剋隆後進行全長cDNA序列分析,併利用Clustal×1.8,TreeView32及DNAStar軟件與參比株Wa、KUN、AU-1、EW及來自GenBank的OSU、SA11、Hochi、US244、Bristol株的NSP4序列進行分析比較.採用PCR分型方法對VP7血清型進行鑒定,確定輪狀病毒G型與NSP4基因型的關繫.結果氨基痠同源性比較錶明,我國輪狀病毒不同流行株NSP4之間同源性為81.7%～99.4%,據此可將27株RV NSP4分為2組,分彆以Wa株和KUN株為代錶,其中以Wa組為主.組內同源性分彆為92.0%～99.4%和92.0%～98.9%,組內變異率分彆為0～8.5%及1.2%～8.5%.兩組間變異率達16.6%～21.0%.氨基痠進化樹提示在Wa組內包括3箇亞組.輪狀病毒G血清型與NSP4基因型之間的聯繫不確定.結論我國流行株NSP4基因主要可分為Wa組和KUN組,在Wa組內可形成三箇亞組,併且在高變區有特徵性的氨基痠位點.NSP4的變異與年份有關而與地域關繫不密切.
목적연구아국륜상병독류행주NSP4기인적변이특점.방법대근년래종아국불동지구획득적27빈인륜상병독류행주적NSP4기인용RT-PCR진행확증,극륭후진행전장cDNA서렬분석,병이용Clustal×1.8,TreeView32급DNAStar연건여삼비주Wa、KUN、AU-1、EW급래자GenBank적OSU、SA11、Hochi、US244、Bristol주적NSP4서렬진행분석비교.채용PCR분형방법대VP7혈청형진행감정,학정륜상병독G형여NSP4기인형적관계.결과안기산동원성비교표명,아국륜상병독불동류행주NSP4지간동원성위81.7%～99.4%,거차가장27주RV NSP4분위2조,분별이Wa주화KUN주위대표,기중이Wa조위주.조내동원성분별위92.0%～99.4%화92.0%～98.9%,조내변이솔분별위0～8.5%급1.2%～8.5%.량조간변이솔체16.6%～21.0%.안기산진화수제시재Wa조내포괄3개아조.륜상병독G혈청형여NSP4기인형지간적련계불학정.결론아국류행주NSP4기인주요가분위Wa조화KUN조,재Wa조내가형성삼개아조,병차재고변구유특정성적안기산위점.NSP4적변이여년빈유관이여지역관계불밀절.
