动物学研究
動物學研究
동물학연구
ZOOLOGICAL RESEARCH
2004年
5期
415-421
,共7页
史燕%吴孝兵%晏鹏%陈壁辉
史燕%吳孝兵%晏鵬%陳壁輝
사연%오효병%안붕%진벽휘
扬子鳄%MHC Ⅱ类B基因第二外元%序列分析
颺子鱷%MHC Ⅱ類B基因第二外元%序列分析
양자악%MHC Ⅱ류B기인제이외원%서렬분석
3头扬子鳄血样取自宣城安徽省扬子鳄繁殖研究中心.利用一对简并引物对MHC Ⅱ类B基因第二外元的部分片段进行扩增;通过克隆、单链构象多态性分析、测序,并将测得序列与下载的8个物种MHC序列比对,确定序列差异和变异位点;利用MEGA软件构建NJ树,PAUP4.0构建MP树.结果得到10种不同的序列,片段长166bp.核苷酸序列中有38个变异位点,氨基酸序列中有23个变异位点;推定的抗原结合位点非同义替换(dN)明显高于同义替换(dS).10种序列的NJ树和MP树极为相似,均为A、B两个分支,两个分支明显的特异性位点核苷酸序列中有9个,氨基酸序列中有7个.表明扬子鳄MHC Ⅱ类B基因第二外元有较高的多态性,有利于扬子鳄饲养种群的遗传保护.
3頭颺子鱷血樣取自宣城安徽省颺子鱷繁殖研究中心.利用一對簡併引物對MHC Ⅱ類B基因第二外元的部分片段進行擴增;通過剋隆、單鏈構象多態性分析、測序,併將測得序列與下載的8箇物種MHC序列比對,確定序列差異和變異位點;利用MEGA軟件構建NJ樹,PAUP4.0構建MP樹.結果得到10種不同的序列,片段長166bp.覈苷痠序列中有38箇變異位點,氨基痠序列中有23箇變異位點;推定的抗原結閤位點非同義替換(dN)明顯高于同義替換(dS).10種序列的NJ樹和MP樹極為相似,均為A、B兩箇分支,兩箇分支明顯的特異性位點覈苷痠序列中有9箇,氨基痠序列中有7箇.錶明颺子鱷MHC Ⅱ類B基因第二外元有較高的多態性,有利于颺子鱷飼養種群的遺傳保護.
3두양자악혈양취자선성안휘성양자악번식연구중심.이용일대간병인물대MHC Ⅱ류B기인제이외원적부분편단진행확증;통과극륭、단련구상다태성분석、측서,병장측득서렬여하재적8개물충MHC서렬비대,학정서렬차이화변이위점;이용MEGA연건구건NJ수,PAUP4.0구건MP수.결과득도10충불동적서렬,편단장166bp.핵감산서렬중유38개변이위점,안기산서렬중유23개변이위점;추정적항원결합위점비동의체환(dN)명현고우동의체환(dS).10충서렬적NJ수화MP수겁위상사,균위A、B량개분지,량개분지명현적특이성위점핵감산서렬중유9개,안기산서렬중유7개.표명양자악MHC Ⅱ류B기인제이외원유교고적다태성,유리우양자악사양충군적유전보호.
